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因此也可以这样理解，源通道是混合色，目标通道既是基色同时又是结果色。可见，计算命令与应用图像命令的第一个差别在于：计算命令一般情况下会产生一个新的通道来存储混合色，从而增加图像包含的通道数量（当然是在不指定计算结果以选区方式存在的前提下），而应用图像命令只会直接改变目标通道，不会增加图像包含的通道数量。但是有一点是相同的，即应用图像命令中出现的不透明度和蒙板选项跟计算命令中的这两个选项作用完全一样。
应用图像和计算两个命令不仅可以对来自同一个文件的通道进行混合，也能够混合来自不同文件的通道，但是这两个文件的尺寸大小必需一致才行。这是因为通道的混合是基于象素的一种运算，所以两个用来混合的通道必须包含同样数量的象素。如果想对尺寸大小不同的两个文件的通道进行混合，可以把一个图像拖动到另外一个图像中。
计算命令中值得注意的是两个源通道的选择。在RGB色彩模式下打开一个图像，调出计算命令，在源1和源2的通道选项中可以发现有灰色通道、红、绿、蓝通道可供使用。红绿蓝三个通道就是一个图像在RGB色彩模式下固有的颜色通道，而这个灰色通道又是如何得来的呢？在一些书籍中提到：这个灰色通道跟彩色图像直接转换成灰度色彩模式得到的灰色通道一样，但是在我的实践中发现并非完全一致，只能说大概接近。同样，如果在CMYK色彩模式下打开一张图片，调出计算命令，在源1源1和源2的通道选项中可以发现有灰色通道、青色、洋红、黄色、黑色通道可供使用。CMYK色彩模式下计算命令中出现的灰色通道也近似的认为是图像直接转灰度色彩模式得到的灰色通道，尽管不完全相同。而在LAB色彩模式下打开一张图片，调出计算命令，在源1源1和源2的通道选项中可以发现只有明度通道、A和B通道可供使用，这也是LAB色彩模式与RGB、CMYK色彩模式不同的一个地方。
如果一个文件本身已经有Alpha通道存在的话，那么打开计算命令的时候，通道选项中将出现文件具有的Alpha通道以供使用。如果打开的文件上有选区，这个选区也会出现在通道选项的下拉菜单中，名称是“选区”。
在应用图像命令中两个源通道的选择也很重要。在计算命令中，是打开对话框之后再来选择基色和混合色的，但是在应用图像命令中，基色是事先指定的，打开应用图像命令对话框之后只能指定混合色。如果在打开应用图像对话框之前未对基色进行指定，那么打开该命令后，基色将默认被设置为RGB通道（视图像使用的色彩模式而定，也可能是CMYK或者LAB通道）。这是计算命令和应用图像命令的第二个不同之处。
观察仔细的人一定会发现在应用图像命令的“通道”选项中，缺少了计算命令中出现过的“灰色“通道，取而代之的是RGB通道（视图像使用的色彩模式而定，也可以是CMYK或者LAB通道）。以RGB色彩模式为例，这个RGB通道到底是指什么通道呢，而目标通道里面的RGB通道又是什么呢？
这是一个稍微有点复杂的问题，要分四种情况进行探讨，因为正是这种基色与混合色具体指定为何种通道，造就了应用图像命令和计算命令的第三个重要区别。第一种情况，也是最简单最容易理解的情况：当基色和混合色都是单独通道的时候，应用图像命令产生的最终通道完全可以用计算命令一次获得。第二种情况：基色是单独通道，混合色是复合通道的时候。比如选中了红通道后再打开应用图像命令，此时混合色中的RGB通道就是在计算命令中的灰色通道。第三种情况：基色和混合色都是RGB复合通道的时候，就是指同色通道之间进行混合，即红色对红色、绿色对绿色、蓝色对蓝色进行混合。所以，效果等同于直接在图层面板中设置的图层混合模式。而由于计算命令只能一次混合两个单独通道，所以计算命令无法一次完成应用图像能够达到的通道效果。第四种情况则是当基色是复合通道，混合色是单独通道时。例如基色为RGB通道，混合色为红色通道的时候，此时效果是这样得来的：红色通道分别跟红色、绿色、蓝色通道混合得到三个新的红色、绿色、蓝色通道。同样，在CMYK色彩模式下也要分上面几种情况，但是基本上跟RGB色彩模式下的原理一样。而在LAB色彩模式下，却是另一番天地了。在第二种情况下基色是单独通道，混合色是复合通道的时候，比如选中了A通道后再打开应用图像命令，此时混合色中的LAB通道就是图像本身的明度通道。在第三和第四种情况下，基色是LAB复合通道的时候，可供使用的混合模式少了很多种。综合以上各方面的认识，我个人以为，排除应用图像命令无法直接将混合后的结果输出为一个全新的通道这个特点，应用图像命令可以说在同时能够混合的通道数量方面比计算命令更强大。因为计算命令一次只能同时混合两个通道，而应用图像命令则在基色为复合通道的时候可以一次同时混合两个通道以上。然而计算命令也有着其优点，因为计算命令中是可以对两个源通道使用反相的，这是应用图像命令缺少的一个重要选项，应用图像命令只能对源通道进行反相，无法对混合色进行反相。此外由于计算命令可以生成新的通道，或者把新生成的通道用于建立选区，这也是应用图像命令无法直接实现的，可以说这两个命令虽然有很多相同之处，但是它们的不同之处也正好是相辅相成。
通道的本质就是灰度图象，故灰度色彩模式是研究通道混合的一个良好产所。在灰度色彩模式下，观察图层混合模式可以发现，比RGB色彩模式下少了几种图层混合模式。而进一步打开计算命令观察，可以发现，通道混合模式中比刚才看到的图层混合模式多了两种，相加和减去混合模式。撇开相加和减去这两种混合模式不谈的话，灰度色彩模式下的图层混合模式就是在计算中看到的混合模式，作用是完全一样的，可见通道混合模式是图层混合模式的基础。在灰度色彩模式下，因为图像是没有色彩的，故图层混合模式中出现的颜色类混合模式不可用。
在通道的混合过程中，正常混合模式也是一种极为有趣的混合模式。我个人更倾向于把正常混合模式当作是一种替换模式（前提是不透明度为100％）。尽管对通道可以直接复制后粘贴到图层中以供使用，或者复制一个通道粘贴到另外一个通道中进行替换，但是对于此类操作同样可以使用应用图像命令来完成。要使用应用图像命令来替换一个通道，只需先选中将被替换的通道，接着打开应用图像命令对话框，源通道设置为用于替换的通道即可。
虽然在RGB色彩模式下使用应用图像命令，目标通道设置为RGB通道，源通道设置为单独通道，混合模式为正常可以完成把通道复制到图层中的操作，但是这种方法有一些地方值得注意。由于在RGB色彩模式下，中性色的表现就是红绿蓝三个通道是同样数值，所以在应用图像命令中，基色设置为RGB通道，源设置为红绿蓝通道中的任意一个的时候，比如源设置为绿通道时在图层面板中得到的图像跟绿通道完全一样。如果在CMYK色彩模式下，基色设置为CMYK通道，源设置为青色、洋红、黄色、黑色通道中的任意一个的时候，比如源设置为青色通道时，在图层面板中得到的图像并非是青色通道，而是一个有色彩的图像。因为在CMYK色彩模式下，中性色并不是四个通道的数值相同这么简单。同样在LAB色彩模式下，如果基色是LAB通道的话，即使混合色是明度通道或者A或B通道，结果图像也不会是设置的混合色通道，而是一个色彩诡异的图像。之所以会出现这种现象，是因为不同色彩模式表现中性灰的方式也是不一样的。然而正常混合模式用于单独通道替换单独通道还是可以放心使用，大可以取代复制后粘贴的操作方式，而且灵活性也更加高，因为可以使用蒙板选项屏蔽部分区域，这是直接复制粘贴无法直接实现的。
当然正常混合模式也并非就只有以上的用法，现在很流行的一种柔软色调其实也是可以利用应用图像命令来实现的。打开一张色彩饱和度比较高的图片，新建一个空白图层，打开应用图像命令，源通道设置为红色通道，混合模式为正常，不透明度为50％，基本上淡淡的色彩就出来了。
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