组织化学法检测以5-溴-4-氯-3-吲哚-β-葡萄糖苷酸酯（X-Gluc）作为反应底物。将被检材料用含有底物的缓冲液浸泡，若组织细胞发生了解gus基因的转化，并表达出Gus，在适宜的条件下，该酶就可将X-Gluc水解生成蓝色产物，这是由其初始产物经氧化二聚作用于形成的靛蓝染料，它使具Gus活性的部位或位点呈现蓝色，用肉眼或在显微镜下可看到，且在一定程度下根据染色深浅可反映出 Gus活性。因此利用该方法 可观察到外源基因在特定器官、组织，甚至单个细胞内的表达情况。
作用原理：gus基因表达出GUS，在适宜条件下该酶可将X-Gluc水解生成蓝色物质，初始产物并不带颜色，为无色的吲哚衍生物，后经氧化二聚作用形成5,5’-二溴-4,4’-二氯靛蓝染料，此靛蓝染料使具有Gus活性的部位或位点呈现蓝色，可用肉眼或在显微镜下观察到。
GusA（uidA）基因编码β一葡糖苷酸酶基因。它是一种催化葡糖苷酸糖苷键水解的水解酶，其中很多水解产物具有发色团或形成荧光物质，因此可以用分光光度计、荧光剂和组织化学法对其活性进行定性或空间定位分析。GusA基因由于具有明显区别于受体细胞遗传背景的选择标记基因，因此可以用来检测组装的嵌合基因在导人细胞后是否具有功能。 GUS组织化学分析中最常用的底物为X—Gluc（5-brom-4-chloro-3-indolyl glucuronide）,在GUS活性作用下，X—Gluc产生一种不可溶的蓝色沉淀（5，5’-二溴，4，4一二氯靛蓝染料）。
