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【串和序列处理 7】LIS 最长递增子序列

 静听沙漏 2012-01-08

LIS:给定一个字符串序列S={x0,x1,x2,...,x(n-1)},找出其中的最长子序列,而且这个序列必须递增存在。

下面给出解决这个问题的几种方法:

(1) 转化为LCS问题

思想:将原序列S递增排序成序列T,然后利用动态规划算法取得S与T的公共最长子序列。具体算法详见《LCS最长公共子序列》。

效率:这个方法排序最好的是时间复杂度是O(n*logn),动态规划解决LCS的时间复杂度是O(n^2)。因此总体时间复杂度是O(n*logn)+O(n^2)=O(n^2)级别。


(2) 分治策略

思想:假设f(i)表示S中 x0 ... xi 子串的最长递增子序列的长度。则有如下递归:找到所有在xi之前,且值小于xi 的元素xj,即j<i 且 xj<xi。如果这样的元素存在,那么所有的xj 都有一个x0 ... xj 子串的最长递增子序列,其长度为f(j)。把其中最大的f(j)选出来,则

f(i)=Max(f(j))+1. 其中{j | j<i 且xj<xi}

如果这样的j不存在,则xi自身构成一个长度为1的递增子序列。

该算法Java源代码如下:

Java代码
  1. package net.hr.algorithm.string;
  2. /**
  3. * 最长递增子序列 LIS
  4. * @author heartraid
  5. */
  6. public class LIS {
  7. char[] chars=null;
  8. public LIS(String str){
  9. chars=str.toCharArray();
  10. }
  11. public void getLIS(){
  12. int[] f=new int[chars.length]; //用于存放f(i)值
  13. String[] sequence=new String[chars.length];
  14. f[0]=1; //以第x1为末元素的最长递增子序列长度为1
  15. for(int i=1;i<chars.length;i++)//循环n-1次
  16. {
  17. sequence[i]=""+chars[i];
  18. f[i]=1;//f[i]的最小值为1;
  19. String temp="";
  20. for(int j=0;j<i;j++)//循环i 次
  21. {
  22. if(chars[j]<chars[i]&&f[j]>f[i]-1){
  23. temp=temp+chars[j];
  24. f[i]=f[j]+1;//更新f[i]的值。
  25. }
  26. }
  27. sequence[i]=temp+sequence[i];
  28. }
  29. //打印结果
  30. int maxLength=0;
  31. int maxSize=0;
  32. for(int k=0;k<chars.length;k++){
  33. if(maxLength<f[k]){
  34. maxLength=f[k];
  35. maxSize=k;
  36. }
  37. }
  38. System.out.println("最大递增子序列为:"+sequence[maxSize]+"(length="+maxLength+")");
  39. }
  40. public static void main(String[] args) {
  41. LIS lis=new LIS("ijabcsrewesdsdewg");
  42. lis.getLIS();
  43. }
  44. }

效率:算法时间复杂度为O(n^2)级别。

(3) 动态规划算法

实际上这是一道很典型的动态规划问题。我们假设a[0]....a[i-1] 有一个最长递增子序列,其长度f(i-1)<=i, 且该最长递增子序列的最后一个元素为b。

那么对于a[0].... a[i] 而言,如果b<a[i],那么f(i)=f(i-1)+1,且最长递增子序列的最后一个元素变成了a[i]。如果b>=a[i],那么f(i)=f(i-1)。

上面的过程有一个难点:如果a[0]....a[i-1] 有多个最大长度为f(i-1)的递增子序列怎么办?需不需要所有长度等于f(i-1)的递增子序列的最后一个元素b0...bi全部存储起来,再一一和a[i]比较大小呢?如果是这样,那么整个算法与上面的分治策略将没有什么不同了?

事实上,并不需要怎么做。我们举个例子: a[]={1、2、5、3、7}

a[0] ... a[3] 的最大递增子序列有两个{1,2,5}和{1,2,3},当增加a[4]的时候,如果a[4]>5,则两个子序列都需要增加a[4];如果a[4]>3,则{1,2,3}+a[4]将必定成为新的最大子序列,而{1,2,5}不确定。因此我们看出,只要保存所有最大序列的最小的末尾元素即可。

因此我们设计一个如下的算法:其中b[k]用来表示最大子序列长度为k时的最小末尾元素。

Java代码 复制代码 收藏代码
  1. int LIS(){
  2. b[1]=a[0];
  3. for(int i=1;k=1;i<n;i++){
  4. if(a[i]>=b[k]) b[++k]=a[i];
  5. else b[binary(i,k)]=a[i];
  6. }
  7. return k;
  8. }
  9. int binary(int i, int k){
  10. if(a[i]<b[1]) return 1;
  11. for(int h=1,j=k;h!=j-1;){
  12. if(b[k=(h+j)/2]<=a[i]) h=k;
  13. else j=k;
  14. }
  15. return j;
  16. }

该算法的时间复杂为O(N*logN)。

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