植物种子在萌发过程中，酶的活化需要很多的水分，任何酶都以水为载体。
浸种，在芽苗菜生长中起到重要作用。不浸种不会萌芽，因为不浸种酶不能活化，接触水才能活化，酶活化后突然水干了，酶就被破坏了。酶的破坏：包括水分缺乏。酶的破坏，淀粉，蛋白质，脂肪就不能转化成供应给胚生长的能量，苗就会长的细，相对于就烂种，所以水分要均匀。过多过少都会烂种。在栽培过程中要注意通气生根，不然也会烂根，在逆境的环境下，如果逆境静止，氧气消耗，而 种子萌芽需要消耗大量的氧气，氧气消耗了，而外界不通风，新的空气进不来，就会缺氧，这种现象不是因为水分过多而引起的，是由于空气当中的氧气缺乏。所以在计算机系统里可以设置每天中午最热的时候要通风15～20分钟换气。
芽苗菜生长中要注意的方面：
1，选种
有伤口的种子，胚根的种子,蛀虫的种子，空的种子都要去除，如何去除呢，我们可以用比重法：
陈种(黄色,黑黄色) (图中左:正常的种子,右:原有胚根的种子) 种子(黑点)
配盐水，把盐水配好，种子放进去，把浮的种子去掉，盐水配的越浓，坏的种子浮起的越多。按照农作物的比重是20%。如没有比重剂，也可以用鸡蛋，鸡蛋直接放水里不会浮起，加盐水，直到鸡蛋浮起。但又不能浮空，浮空了要再加水。 这样就更利于把那些不好的种子去除。
2，浸种：
不同种子浸种时间不同，一般在20～25度之间，在50度的温度下不能过长，因为这个温度主要是起到杀菌作用，浸种要达到什么程度，不同种子浸种时间不一样，发涨程度也不同。原来种子的百分之多少，是做为它浸种的标志。浸种时间过长也会烂根。
3，播种
播种过密,太厚(底层种子容易无氧呼吸) 尽量稀植,氧气充足,有利于苗菜生长
播种过密种子堆积在一块，它的呼吸作用，氧气跟种子均匀播种时就不一样，种子堆积多了，就会造成缺氧，排水差，发热。这些对芽苗菜的生长都不好。播种要均匀，不可过密。如一斤种子本来播3盘，可以把它拨4盘或5盘，防止烂种。
4，温度过高或过低 酶的活性，一般在20～25度最适宜，30度以上，酶的活性受到抑制，40度以上，酶基本上受到破坏。
5，水是任何代谢的载体，呼吸作用以及各种物质酶的活化以及各种反映，它都需要这些植物载体，水分不宜过多，过多会出现以下情况：
缺氧 水跟氧是矛盾的，托盘里如果排水不好，水分多，就无氧。无氧放出的能量很少，同样的一颗代谢物放出的AtP能量跟无氧呼吸相差5倍或更多，如果浸种时间过长，芽苗菜会长的细而弱，因为无氧呼吸能量已经消耗了，就比如做豆腐，种子浸的时间长了，豆腐产量就没了，因蛋白质已经分解。浸种时间的把握也很重要。
6，病菌，细菌的浸染
空气当中病菌、细菌很多，但病菌、细菌对饱满、活力强的种子浸染力低，对那些不饱满、小颗的种子，蛀虫的种子，不成熟的种子或有伤口的种子就很容易感染。
7，环境消毒
最宜采用电场,紫外线等物理方法来消毒。
8，管理
发现有烂种，就要去除，防止感染。不同的栽培环境，栽培方法，不同的温度，烂种程度都不一样，夏天温度过高，病菌，细菌滋生烂种就快。
烂种的原因要从每个环节去克服，这样芽苗菜才会长得更好。
