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qPCR引物已经不用设计了,直接搜库

 zhongguorui 2017-08-01

引物最早的设计全凭手动,公式大概是这样的



害怕,数学没学好基本上就不能学生物的样子,不过现在并不是很复杂,比如现在去PCR引物,都已经有了数据库,比如:



这个库里包含了人类相关的RNA的99.6%基因,只要输入NM登陆号,或者基因名字,就能搜到人家已经验证过的qPCR引物,是不是很简单:



同样,还支持in silico PCR验证会不会扩增到Genomic DNA上:



当然,Taqman的探针就需要自己来设计了,不过也没那么复杂,如果你不太熟悉AelleID或者Primer3的话,就用这个,也行:



直接把FASTA格式的序列贴进去:



然后,就自动设计好了:



当然会显示具体的探针引物所在位置咯:



是不是已经很简单了。

华丽丽的分割线


李莫愁博士:其实引物设计并不需要纠结,即使设计好了,还需要实验验证扩增效率。Taqman的话,扩增效率全看引物,所以调整的时候,不用去改变探针,这样就能省些经费了。好了,今天就先策到这里吧。网址都写帖子里了,自己找找哈。


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