信息的丢失则导致测序获得的表达量低于实际表达量。因此,duplication过高意味着表达量 的分析不够准确。 3. Duplication比较 我们将同一样本,分别使用康测链特异性转录组建库试剂盒和常规商品化试剂盒分别进行 建库,并比较两组测序数据的duplication,和去除重复(deduplication)后的水平。 下图左侧为康测转录组建库试剂盒建库效果,uniquereads约为60%,通过去重复,unique reads达到85%以上;右侧为常规商品化试剂盒建库效果,去重复前后,uniquereads分别 低于20%和低于60%。 可以看出,同一样本,使用康测转录组建库试剂盒进行建库,产生的duplication更低,对表 达量的分析更为准确。 注:横坐标为reads重复的次数,纵坐标为重复次数对应的reads占uniquereads的比例, 以uniquereads的总数作为100%。 |
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