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作者：Dr. 饕餮 转载请注明：解螺旋·临床医生科研成长平台 近年来，非编码RNA调控成为的生物学研究，特别是疾病研究的热门领域。其中，环状RNA（circRNA）是一类近年来刚被鉴定出有重要的生物学功能的非编码RNA。环状RNA是指头尾相接成环状的RNA分子，其产生的方式十分多样。因为缺乏5‘和3’末端，circRNA相对于线性RNA更难以被降解，因此大量存在于细胞组织中。 尤其，近年来发现环状RNA在多种疾病中有特异的表达模式，并行使重要的生物学功能。其中，环状RNA在疾病中的表达研究是研究环状RNA功能的第一步，今天，就带大家来看看疾病中环状RNA研究的套路。 例子是一篇今年八月中国研究者发表在SCI REP上的文章： 从题目可以看出，是环状RNA在胃癌（gastric cancer）中的表达谱分析，全文基本都是分析，只有qPCR一个实验，让我来带大家仔细看看。（回复170910可下载，一周有效） 1 首先，作者在5对成对的胃癌癌和癌旁组织中进行了环状RNA表达分析： 发现了一批高表达和低表达的环状RNA，并对应列出了产生环状RNA的基因（母基因）： 2 得到了表达之后，下一步当然是验证了，作者扩大样品量，在50对成对的临床样品中使用q-PCR验证了芯片结果，证实了芯片的可靠性： 3 差异表达的环状RNA可能的功能是什么。不像非编码RNA有来自于基因间的，环状RNA基本都来自于基因座位，先看看差异表达的环状RNA的母基因的功能聚类，可能会有一些线索： 聚类结果显示环状RNA可能和生长素结合，黏附分子结合等相关。暗示了它们的潜在功能。 4 接着，环状RNA的作用方式现在还不是十分明确，其中，报道比较多的是作为分子海绵吸附miRNA，因为它能长期稳定存在，所以这种吸附作用被认为更加稳定。于是，作者分析了差异表达环状RNA上的miRNA作用位点： 进一步的，作者就三个差异最大的circRNA绘制了预测靶向miRNA的网络图，可以看到有很多交叉的miRNA，暗示靶向网络的复杂性： 就这样，一篇环状RNA在疾病中的表达研究就完成了，是不是很容易呢？所以，只要选择合适的疾病，加上有套路的实验设计，临床样品中环状RNA也是非常容易出文章的研究领域。 5 近十年来，RNA相关疾病表达谱的研究经历了mRNA，miRNA到现在很多的lncRNA和circRNA阶段，相比于lncRNA来说，环状RNA研究开始的更加晚。很多疾病中的环状RNA表达情况都没有被报道，因为跟母基因相关，环状RNA从一定程度上可以预测功能，或者像文章作者那样基于miRNA预测也十分实用。 总之，疾病的环状RNA还是一片科研的处女地，而国内也有很多提供此服务的公司，推荐有临床样品的各位可以尝试。 |
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