5分钟看完13分的文章的逻辑性

要看一篇蚊帐的逻辑性，主要看些什么呢？其实很简单，光是看看Fig. Lengend就差不多够了。可能几分钟就应该能知道这篇蚊帐是用什么样的方式来的。今天就来看一篇LncRNA对于STAT3蛋白磷酸化功能影响的蚊帐：

这篇蚊帐发表在Hepatology（IF=13.246）,其实这篇蚊帐算是中规中矩的，除了展示了一下这个LncRNA对于STAT3的蛋白磷酸化，导致下游基因转录变化的过程，其他都算是按照套路出牌的。

这篇蚊帐一共8张图，Fig. Lengend分别是这样：

从上到下，我们可以看到这篇蚊帐完整的逻辑关系。首先要确认为什么要做这个LncRNA，肿瘤中有差异表达，而且低表达的患者死得快，这就是对这个LncRNA感兴趣的原因：

既然有表达差异，那表达差异后，是否对肿瘤的功能有影响？那就涉及到功能实验，在这里做了敲减和过表达的功能实验，增殖的，和迁移侵袭的：

当然，造成这种功能表型的原因又是什么？最简单的方法就是敲减和过表达这个LncRNA后，看下游基因的表达变化，做来做去也就是做个芯片，发现敲减LncRNA后，增殖和迁移侵袭的基因表达增加：

上面这些无论是细胞表型，还是下游基因的表达谱，我们都可以把它看作为LncRNA的表型实验。关键的机制，都是直接的相互作用，于是就做一个RNA Pulldown，很幸运，拉下来一个STAT3：

知道JAK/STAT信号通路的童鞋，都应该知道STAT3起到的是什么作用。同时表明STAT3的转录功能变化也和这个LncRNA有关。STAT3作为转录因子，和LncRNA结合影响了下游基因的表达，就能把之前的增殖和迁移侵袭的基因表达增加说通了。

由于是转录因子，而转录因子转录激活功能的变化，主要就和它的磷酸化激活有关，于是做了一下STAT3和这个LncRNA结合，对于STAT3两个位点的磷酸化影响，发现确实有变化：

接着引入了另一个蛋白TKT，这个蛋白被报道过和STAT3的磷酸化有关，结果发现这个LncRNA确实能影响两者的结合：

最后，将STAT3和TKT的磷酸化，又回归到临床上验证一下：

然后产生了这样的一张简单的模式图，其实用InkScape能画的比这个好看很多：

华丽丽的分割线

李莫愁博士：从Fig. Lengend里，我们不用特别仔细去看蚊帐的本身，也能理解整篇文献所表达的故事逻辑，这些思路也都是按照逻辑来一步步往下延伸的。你要问了，要是RNA Pulldown的时候，没拉下来STAT3的话怎么办呢？要是磷酸化位点没变化怎么办呢？要是不会影响TKT和STAT3的结合要怎么办呢？那可能就是另一个故事了，探索到的有价值的内容越多，蚊帐的意义就越大。

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