分享

又全又好用的药物数据库看过来!

 沙亮哥哥 2018-03-02

前天上灯,吃了汤圆,结果汤圆歪瓜咧枣的,让我想到了自己养的细胞也是这样的,心中一阵唏嘘;今天元宵节,同样吃汤圆,一个个汤圆圆润饱满,看着就非常喜人,真是希望自己养的所有的细胞都是这般讨喜呀!说这么多,就是想祝大家元宵节快乐,细胞长得壮壮哒,人也健健康康的!


今天给大家介绍的是一个药物相关的数据库L1000FWD(http://amp.pharm./L1000FWD/),这个数据库可以帮助你找到药物作用的机制哪些基因发生差异表达等等,功能相当强大,并且数据非常全!


网站加载数据需要一点时间,因为一开始就要加载下面这样一张复杂的全局图。

这张图在说些什么呢?我们一点点来看。

点的形状代表药物处理时间颜色代表作用机制(具体是哪个通路的抑制剂),鼠标放在点上就会显示具体的实验信息:用的什么药,多长时间,剂量如何,什么细胞系。


初步介绍了怎么看这个图之后,我们来看下我们用的时候要怎么选。

在图的右边,我们可以选择不同的标识,比如按照p-value和剂量来选择点的形状

同样的颜色设置也可以有许多不同的选择:


我们选择不同的药物,就能在整张图中高亮显示


点开之后,就能查看药物使用报告,我们可以获取在当前作用条件下哪些基因产生了特异性的表达,并能在线做功能富集分析。


同样的,我们也能根据特异性表达的基因来寻找相关的药物以及作用机制


关注某一细胞系?没问题,这里有大量的细胞系可供选择!


    本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,请点击一键举报。
    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多