前天上灯,吃了汤圆,结果汤圆歪瓜咧枣的,让我想到了自己养的细胞也是这样的,心中一阵唏嘘;今天元宵节,同样吃汤圆,一个个汤圆圆润饱满,看着就非常喜人,真是希望自己养的所有的细胞都是这般讨喜呀!说这么多,就是想祝大家元宵节快乐,细胞长得壮壮哒,人也健健康康的! 今天给大家介绍的是一个药物相关的数据库L1000FWD(http://amp.pharm./L1000FWD/),这个数据库可以帮助你找到药物作用的机制,哪些基因发生差异表达等等,功能相当强大,并且数据非常全! 网站加载数据需要一点时间,因为一开始就要加载下面这样一张复杂的全局图。 这张图在说些什么呢?我们一点点来看。 点的形状代表药物处理时间,颜色代表作用机制(具体是哪个通路的抑制剂),鼠标放在点上就会显示具体的实验信息:用的什么药,多长时间,剂量如何,什么细胞系。 初步介绍了怎么看这个图之后,我们来看下我们用的时候要怎么选。 在图的右边,我们可以选择不同的标识,比如按照p-value和剂量来选择点的形状: 同样的颜色设置也可以有许多不同的选择: 我们选择不同的药物,就能在整张图中高亮显示 点开之后,就能查看药物使用报告,我们可以获取在当前作用条件下哪些基因产生了特异性的表达,并能在线做功能富集分析。 同样的,我们也能根据特异性表达的基因来寻找相关的药物以及作用机制 关注某一细胞系?没问题,这里有大量的细胞系可供选择! |
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