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10秒钟-完美掌握-热图(heatmap)绘制 - 所有人都可以!

 生信药丸 2021-07-26

写在前面

热图,Heatmap,其实是几乎所有领域都有可能用上的一种数据可视化实现。在生物信息数据分析中,热图有太多用户,此处不展开。因此,

关于热图的绘制,有太多的方法

  1. 各种统计软件会有热图模块 -- 学习成本高

  2. Excel也可以做热图 -- 但是没有聚类信息,当然所有人都可以学会 详细可见之前推的一个教程  使用Excel绘制热图 - 太简单!

  3. R语言默认热图函数heatmap以及.2,另外是R语言中各种热图输出包 -- 学习成本...还可以,详细可见之前推的一个教程  最简单最实用的R语言热图绘制教程(没有R基础-掌握只需10min),而高级的教程,当属Y叔的,详细见 听说你还不会画热图

  4. 是用专门的热图绘制软件HemI -- 很好用,一个纯粹的画热图的软件,但是还是不能满足我常见的需要,比如行标准化

以上,都指向一个问题,那就是

他们都不能满足我,那么怎么办?

当然是,写一个!!!

具体实现方式,省略一万字,我们直接进入主题,
最终的实现结果,操作如下,

1. 打开TBtools

2. 选择热图工具

3. 复制黏贴

4. 点击Start

完成了....其实我觉得不用10秒钟就可以学会并出图....

这么多参数,如何优化?

这个热图,是可以拖拽的,图例是可以一种的,
大小是可以调整的,
基本参数都写得很明白了,如果是出一个上面的热图需要5s,那么出一个下面的热图,就真的需要10s

因为手移动鼠标的时间需要+5s.

我录了一个视频教程,但是效果似乎不太好,可以加TBtools使用交流群,在群共享下载(QQ群:553679029)

写在后面

....热图还是很受欢迎的,自然会有朋友希望把热图和其他图片一起整合,But,目前来说,我个人没有精力而似乎也没有需求做这个(可能医学的朋友需要的多些)。所以还是希望大家实际点哈,如果是高级的Feature Calls,直接找下面这位小伙伴,号称,一个脚本,输出以下图片,注意,是自动拼好图!!!!

详细见 72h,小白也能画出CNS图


最后....

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