DARNED数据库收录了human等多个物种的RNA编辑位点信息,除了最常见的A->I类型的RNA编辑外,还收录了部分C->U的RNA编辑位点,网址如下
该数据库包含的物种如下
官网提供了三种检索方式 1. region-based
2. gene-basedgene-based支持直接检索某个基因上的RNA编辑位点信息,搜索框如下 3. sequence-basedsequence-based支持直接输入一段序列,首先确定该序列在基因上的位置,然后给出对应区间的RNA编辑位点信息,搜索框如下 以human基因 在检索结果中,会给出每个RNA编辑位点的类型,染色体位置,对应的基因,SNP, 是否位于Alu重复序列上等信息。 该数据库是免费下载的,可以从以下链接下载到各个物种的RNA编辑位点信息
相比RADATR数据库,该数据库中收录的RNA编辑位点数量会少一些。 ·end· |
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