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蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。运用蛋白质组学技术可以大规模研究蛋白质的特征，包括蛋白质的丰度水平，蛋白质翻译后修饰，蛋白-蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。 近年来，随着蛋白质组学技术发展突飞猛进，蛋白质组学技术也成功应用于生命科学研究的方方面面。同时，国家也对蛋白质组学研究给予大力支持与引导，例如2017年的“生物大分子动态修饰与化学干预重大研究计划”、2018年“蛋白质机器与生命调控重点专项”。蛋白质组学可谓炙手可热。 那么如何利用蛋白质组学申请科研项目，并快速发表文章呢？小编结合自身多年蛋白质组学技术服务经验给大家介绍一些常见的蛋白质组学研究模式： 一、 通过蛋白质组学寻找疾病发生发展的新型标志物 这种模式是以常见的临床样本如血液、尿液、脑脊液等为研究对象，首先通过TMT、Labelfree等定量蛋白质组学技术对这些样本中全蛋白组或修饰蛋白组进行鉴定和定量，寻找新型的用于疾病诊断、发展、分型、治疗以及预后的标志物。研究的套路简单，问题在于大样本的收集，分组以及临床信息的采集和分析。 标志物挖掘思路： 1.Discovery set：小样本（≥20个）血清/血浆/尿液样本，进行全蛋白质组学或修饰蛋白质组学； 2.标志物筛选：生物信息学分析对差异标志物进行功能注释分类分析，结合数据与研究背景筛选出若干个candidatebiomarker； 3.Validition Set：扩大样本量（≥80-100个），针对candidate biomarker进行靶向定量研究（PRM），构建ROC曲线，与临床病理参数进行相关性分析来评价效果； 4.单分子研究：对某一个特别关心的蛋白进行深入的分子机制研究。 文章案例分享（一个案例对应一篇高水平文章，点击进入了解研究详情） 1、Hepatology：鉴定血清外泌体中与胆管癌相关的蛋白生物标志物 5、“岂止于瘦”……蛋白质组学揭示瘦身过程中的血浆蛋白质的动态变化 中标项目案例
二、与其他组学整合建立疾病相关表达谱 这种模式是以临床组织、动物模型组织、细胞系等样本为研究对象，整合蛋白质组学与其他组学，譬如基因组、转录组、代谢组学、脂质组学等，从DNA、RNA、蛋白质、代谢物等多个层面绘制疾病组织或细胞的分子表达谱，全面解析疾病发生、发展机制。 多组学研究思路： 1、通过蛋白质组学或转录组学，分别从RNA和protein水平描绘分子表达谱，找到研究主题相关的调控网络，如代谢通路、信号转导途径等，或者关键分子，如蛋白激酶、泛素连接酶、去酰化修饰酶等； 2、通过修饰蛋白质组学绘制疾病的蛋白质翻译后修饰图谱，解释RNA与protein相关性问题，同时围绕修饰对应酶类进行分析讨论； 3、通过代谢组学绘制疾病代谢物谱图，作为解释RNA与protein表达调控代谢物的直接证据。 4、多组学整合分析，利用生物信息学方法将多组学数据整合，对单一层面机制结合其他层面进行修正与补充。 文章案例分享（一个案例对应一篇高水平文章，点击进入了解研究详情） 5、凤栖于桐，明非而止——我国学者利用蛋白质组学对胃癌进行分子分型并揭示潜在治疗靶点 中标项目案例
今天的内容就分享到这里，大家看完了别忘了收藏起来，后面反刍一下慢慢吸收哦。 另外，后面小编会整理一些热点领域的蛋白质组学研究进展，如果您有什么好的建议请立刻马上随时联系小编本人。 |
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