NGS数据压缩和传输
bcl2fastq
fastq QC
fastq->vcf在线运行
样本管理,支持proband-only、trio、大家系样本信息录入
样本进度(提取、建库、测序、数据下机、分析、报告解读…)
在线画家系图工具
vcf自由组合筛选规则在线筛选
多个点突变数据库自动注释(dbSNP、clinvar、HGMD、ExAC、gnomad…)
疾病和表型数据库及表型筛选(OMIM、HPO..)
基于WES的CNV分析结果(多倍体、UPD、CNN-LOH、CNV、嵌合体)
CNV数据库辅助解读
实时显示已记录进系统的样本的 突变的突变型基因频率
bam文件可视化(cytoband、标尺、reads pileup图,wig峰图)
GA4GH REST API
reads search,variant search,json parser
igv.js可视化
报告在线编辑
ACMG突变自动评级
生成排版好的pdf报告
已完成病例检索(基于表型,基于名称,基于日期,基于基因,基于突变)
一代测序在线分析(支持上传ab1格式数据分析)
工业标准化的NIPT(含无创单基因病)、CNVseq、WGS、WES肿瘤辅助用药、ctDNA,16s-rRNA,RNAseq等临床NGS数据分析支持
本地化的靶向用药数据库和 微生物分类数据库
可选的fastq->vcf 加速分析方案(通用计算平台计算和GPU/FPGA加速)
在线引物设计(根据给定位点自动选引物),可获取指定基因的序列或指定基因的指定外显子序列
bam可视化(基于igv.js)与一代测序结果对齐
支持规模化数据量和平台扩容,高并发访问请求支持
位点与疾病关联注释和审核权限设置
疾病分类索引
在线局部、全局比对、pair wise比对
样本间亲缘关系分析、样本性别分析、祖源分析
指定疾病/表型,寻找样本相对于其他样本显著差异的最小突变集合
公有云支持
芯片数据分析支持(复杂疾病风险、个人特质、药物敏感性、营养代谢、耐力与爆发力、遗传疾病携带)