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酷热难耐 文献消暑 2019年的7月19日，曹雪涛团队在顶级学术期刊Science上在线发表了题为“Nuclear hnRNPA2B1 initiates and amplifies the innate immune rsponse to DNA viruses”的研究论文 文章报道hnRNP家族中的hnRNPA2B1可以识别外来的病毒DNA。继而激活TBK1-IRF3信号通路，促进炎症因子IFN-α/β的产生。另外，hnRNPA2B1可以调控cGAS、STING和IFI16 mRNA水平的甲基化修饰以及核质运输直接调控STING依赖的抗病毒先天免疫活性。 对于做RNA研究的小伙伴并不陌生，hnRNPA2B1是一种RNA靶向蛋白，也有非常多的高质量论文报道其可以调控RNA的甲基化。曹雪涛院士团队的这项研究成果更新了我们对这个蛋白的认识，也拓展了我们对外来DNA感受器的知识，可以说很有创意，知识很新，很有意思。 科学研究往往是有点及面的一个过程，主要就是要抓住那个创新点，同样的实验条件和实验技术才会产生事半功倍的效果。小榴莲今天想和大家首先学习一下这篇Science是如何设计的。 为了寻找潜在可作为外来DNA感应器的蛋白，工作人员对单纯孢疹病毒HSV-1(F-strain)基因组DNA进行生物素修饰，之后感染AW264.7细胞，然后在细胞核提取物中特异性的识别生物素修饰的DNA就可以沉降出与该病毒DNA相结合的蛋白，之后通过质谱分析蛋白种类。同时，工作人员利用SDS-PAGE对HSV-1感染后的细胞核蛋白和质蛋白分别进行抽提，然后对HSV-1感染后从细胞核转移至细胞质的蛋白进行质谱分析。两种方法对比分析之后，研究人员共鉴定出23种潜在的能结合病原体来源的DNA的蛋白。 小榴莲总结了一下 这种类型的实验设计可分三步 何为筛选器？ 一，筛选器的设计应该是基于一个贴近热点且具备可操作性的问题出发 （比如这篇文章的问题，存不存在新的识别外来DNA的蛋白？再比如是什么影响了RNA的降解？是否有未发现的蛋白可以读取RNA甲基化信号？） 二，设计有差异化的筛选方案，重复别人的方法就像吃饭吃被人嚼剩下的，自然没有滋味。（比如一言不合就测序，没有个性和灵魂的筛选方案注定不会产生顶级课题） 三，采用两套甚至两套以上面向同一目的的筛选方案，通过对比，确立出更精准的研究目标。 反应炉 如果一个实验方案从来没有被实施过，那么肯定还需要反复推敲实验的可行性、实验的技术难点，进而不断地优化实验方法和步骤。 最终得到有差异化的筛选结果 之后才是结合已有知识进行更加逻辑的科学探究和证明，对于特别的好的课题，还可以进行课题繁殖，做深做细，让课题爷爷生出课题儿子，课题儿子生出课题孙子，环环相扣无穷尽。 现在这个报道中，hnRNPA2B1可以识别病毒DNA，那么在病毒感染，细菌感染的动物模型上，hnRNPA2B1又是在何种细胞表达通过何种细胞间的调控网络而调控疾病？这些问题，相信不久的将来就会见分晓。 如果有想阅读这边篇文献的小伙伴，为方便您手机阅读，可以在关注“科研小榴莲”后发送“A2B1”进行查看。 小榴莲今天的分享就到这里啦 欢迎大家留言讨论 科研小榴莲拥有免费资料分享群 欢迎加微信入群: hq_3690 特别推荐 |
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