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实操:通过SEER数据库发一篇SCI系列(十一)

 大壮歌 2019-09-08
吴军新书《格局》里说有一章节的题目是:不要成为积极的废人。书中说道,越穷越忙,越忙越穷,这是很多人当下的困惑。
而这些人通常有三个毛病:一、干了太多不该干的事情;二、喜欢同时做很多事情;三、迷信所谓的速成。
上个月我们科室加班加点,好不容易将月手术量冲至100+台,本以为能多挣点囤币的钱,可结果还不如上上个月,分析原因,医院规定的各种指标超标,遭到狠狠扣罚,严重打消医务工作者的积极性。
大的原因不分析,因为涉及到体制问题。从小的说起,自己就犯了三个毛病的第一条,干了太多不该干的事情。

为了提高手术量,加快周转速度,科室临床工作量增加了30%以上,每天早上7点到科室,晚上9-10点才下班,还好媳妇也很忙,还好没生娃,不然真的对不起媳妇对不起娃。
因此,我们在日常工作中,在做一件事之前可以尝试避开以上穷人的三个毛病,多花时间做一些真正有助于自己成长的事。
当下的生活,选择得过且过还是另有打算?

上一个月研究SEER遇到困难,于是干脆将其抛到一边研究比特币冷钱包去了,发现比所谓的科研要有趣的多,研究完并制作自己的冷钱包之后,不得不回归SEER了。思来想去,计划研究几篇SEER范文,试图通过范文为模版,照葫芦画瓢弄出自己的一篇文章。
本次研究一篇关于SEER范文的,文章题目:关于非小细胞肺癌肺胸膜侵犯的预后价值:一项倾向得分匹配的seer数据研究。

研究背景与目的


肺胸膜侵犯(VPI)肿瘤一直被报道为非小细胞肺癌预后不良的因素。

国际肺癌研究协会(IASLC)建议将胸膜侵犯的情况分为
PL0:肺实质周围肿瘤或弹性层下胸膜结缔组织表面浸润肿瘤;
PL1:弹性层外浸润的肿瘤;
PL2:肺胸膜表面的肿瘤;
PL3:肿瘤侵入胸膜壁层。
VPI对不同淋巴结状态和肿瘤大小的预后价值存在争议。

因此,更详细的非小细胞肺癌VPI状态的预后价值需要验证。

我们的研究目的是确定VPI的存在是否影响倾向匹配后的非小细胞肺癌手术切除后的癌症特异性生存率。我们的第二个目的是检测VPI的存在与肿瘤大小和淋巴结状态之间的潜在相互作用。

研究方法及结果解读

1

使用2015年11月通过SEER*Stat软件从SEER注册中心提交的数据(版本8.3.2,http://seer./seerstat/)。为了从数据库中获取足够的数据,选取过程如下(图1):纳入SEER数据库(1973-2013)中NSCLC的患者,接受节段切除、肺叶切除或全肺切除的患者也包括在内。

如上图示,纳入总共953190例患者资料,其中排除了239531例非原发的肺癌、排除了598896例没有做手术的、排除了7116在手术前接受过放疗的、排除了92385没有记录肺脏层胸膜侵犯的、排除了M1远处转移的,排除了44例N3转移的,排除了3024例T3-4,排除了76例没有分期的,排除了T2的阻塞性肺叶及肺不张、排除了1361例缺失值的资料。

2

Table1以是否为VPI分组,将两组病人进行PSM分析,匹配比例为1:1。匹配的卡尺设置为0.1。保证两组基线数据没有统计学差异。
3

这是一个关于肺癌特异性生存率的单变量与多变量的Cox比例风险模型;
结果解读:先单变量分析得出VPI、age、tumor size、grade、N stage是肺癌特异性生存率的危险因素,然后继续行多元COX回归模型分析,得出VPI(+)导致肺癌特异性死亡的风险比VPI(-)高59.27%。
4

PSM前后VPI患者与无VPI患者基线变量标准化差异。A图表示有无VPI在PSM前后基线变量的标准化差异。B图表示有VPI(水平线以下为零)和无VPI(水平线以上为零)患者倾向评分的镜像直方图。
结果解读:这张图不知道怎么生成的,但是可以用Table1来替代,只是Table1中没有显示匹配后的P-value
5

图A所有匹配后按VPI状态(有无)分层的肺癌特异性生存(LCSS)曲线。VPI(-)组中位随访时间20(9-34)个月,VPI(+)组中位随访时间18(8-31)个月。图B是匹配后N0疾病是否存在VPI的LCSS曲线。图C匹配后N1疾病是否存在VPI的LCSS曲线。图D匹配后N2疾病是否存在VPI的LCSS曲线。
结果解读:VPI的存在与癌症特异性生存率显著降低(3年生存率:84.6% vs. 75.9%, P = 0.005);仅在N0状态下VPI患者和无VPI患者的生存率有显著差异(3年生存率:88.8% vs. 81.3%, P < 0.001),但在N1或N2疾病中无差异(图3B-D)。
6

图4 (A) VPI患者匹配后分层PL1和PL2的lcs曲线。(B)与N0疾病中以PL1和PL2分层的VPI患者匹配后的LCSS曲线。(C)经匹配后,N1型VPI以PL1和PL2分层的患者LCSS曲线。(D)对N2期VPI患者LCSS曲线进行匹配后,以PL1和PL2分层。

结果解读:在VPI存在的患者中,PL1和PL2在LCSS上没有显著差异(图4A)。无论淋巴结状态如何,PL1和PL2的生存率差异均不显著(图4B-D)。PL1和PL2对肺癌特异性死亡或其他死因的影响无显著差异。
7

图5 (A)匹配后≤1cm N0肿瘤有/无VPI的LCSS曲线。(B)匹配后1-2 cmN0肿瘤有/无VPI的LCSS曲线。(C)匹配后2-3cmN0肿瘤有/无VPI的LCSS曲线。(D)匹配后3-4 cmN0肿瘤有/无VPI的LCSS曲线。(E)匹配后4- 5cm肿瘤有/无VPI的LCSS曲线。
结果解读:为了更好的表征VPI状态与肿瘤大小的关系,我们将N0状态下的患者按肿瘤大小1 cm递增(≤1cm, >1 ~≤2cm, >2 ~≤3cm, >3 ~≤4cm, >4 ~≤5cm)进行分层。生存曲线比较如图5A-E所示。≤1 cm、>3-4 cm、>4-5 cm肿瘤有无VPI对肿瘤特异性生存率无显著差异(图5A、D、E)。然而,1-2 cm(图5B, P = 0.034)及2- 3cm伴有VPI的患者(图5C, P < 0.001) LCSS明显低于无VPI的N0状态患者。

研究结论


本研究表明VPI的存在对非小细胞肺癌患者的生存有不良影响,尤其是N0,而非N1或N2。PL1和PL2之间无预后差异。随着肿瘤瘤体体积的增大(除外肿瘤大小在1-2cm,2-3cm之间)和淋巴结转移数目增多,VPI其副作用逐渐消失。对于≤1 cm肿瘤尚需进一步研究。综上所述,随着N分期的增加和肿瘤大小的增加,VPI对生存的负面影响逐渐消失。

                                    图片来源网络

为什么做一件事怎么这么难,原来是我们做决定做一件事的刚开始就想的太单纯,上面这张图可以完美形容。

周末毒鸡汤:你现在的人生,就是你过去选择的总和。

Reference

Yang X , Sun F , Chen L , et al. Prognostic value of visceral pleural invasion in non-small cell lung cancer: A propensity score matching study based on the SEER registry[J]. Journal of Surgical Oncology, 2017.

END

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