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尿石的形成不是单一因素所致，而是多种因素的作用结果。所谓尿石的“成因”，包括了尿石的形“成”和原“因”2个不同概念。 尿石形成的原因有宏观和微观因素，宏观因素在于机体的内外环境的变化，主要体现在代谢平衡的失调，电解质及酸碱平衡的紊乱。成石的微观因素在于尿液微环境的热动力学变化，主要体现在尿液中液相与固相转化的能障梯度变化，过饱和与尿液成石抑制因子对立力量的失衡。引起尿结石的六大重要因素是高草酸尿症、高钙尿症、高尿酸尿症、高或低pH尿、低枸椽酸尿症及低尿量。 结石的形成过程主要可分为成核、生长、聚焦、固相转化等过程。在此过程中有多种促进成石物质与抑制成石物质的参与。促进成石物质包括：钙离子、草酸、磷酸、尿酸、蛋白质等因素；抑制成石物质包括：枸橼酸、镁离子、焦磷酸盐、大分子物质葡糖胺聚糖、RNA分子片段等。Curhan等指出尿液中的尿量、钙、镁、草酸、枸橼酸、钠、钾、磷和尿酸等与结石形成最密切，它们的浓度会影响结石的发生。尿液的成分与结石的形成密切相关。当尿液的成分发生变化时，结石就有可能在尿液中形成。尿液成分的变化，主要与体内代谢的变化有关。通过24h尿成石危险因素评估患者的代谢状况，结合药物及饮食指导能有效降低尿石症的复发率。
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