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榴莲启示录,猫山王榴莲的全基因组测序技术在新冠疫情中的应用

 昵称70743283 2020-09-27


猫山王榴莲在2017年首次对其基因组进行了测序。该发现还解密了榴莲气味的原因,已在国际领先杂志上发表。该研究是在新加坡进行的。马来西亚首席科学官一直对此感到羞耻。

“他们排序了我们的国家榴莲!下次,我们决不能让马来西亚以外的国家领先类似研究课题。”

DNA测序揭示了组成DNA分子的结构单元的顺序,科学家可以确定DNA片段的遗传信息。从那里,可以找到导致疾病的特定基因。通过分析不同生物的独特遗传序列,还可以将这些信息用于识别目的。


马来西亚为非医学用途的少数端到端下一代测序(NGS)服务提供商之一。NGS是一种DNA测序技术,以其速度和测序量彻底改变了基因组研究领域。

在过去的十年中,NGS技术得到了极大的改善。现在,它可以在一天之内完成整个人类基因组的测序工作。

当Covid-19大流行来袭时,与马来亚大学(UM)对冠状病毒进行测序,这是该国首例。必须这样做,以便科学家可以研究该病毒的起源以及它在马来西亚的变异情况。

“通过比较一种Covid-19菌株与另一种Covid-19菌株的基因组相似性,我们可以获得有用的信息以进行接触者追踪。共享相同基因组序列的菌株很有可能来自同一簇。”

NGS的用途

使用该技术来检查食品、农业和水产养殖业的产品质量,也用于环境监测计划以及学术界的研究。

假设收到一份肉样品,其成分未知。可以使用NGS对样品进行测序。从结果中,可以根据存在的每种生物的独特DNA序列找出样品的成分。“例如,我们可以产生10,000个DNA序列,发现其中50%属于鸡,40%属于牛,10%属于猪。”

NGS在检测食品方面也非常有效。可以通过对食品进行DNA测序来了解其纯度。知道是否添加了任何异物或细菌以及病毒。

“我们正在努力提高食品安全标准,随机抽取了样本,对其进行了测试,然后发现了异常的物质。我们向制造商或进口商展示了结果,他们对此感到震惊。”

NGS与野生动物

将NGS用于野生动植物管理。该技术可用于管理野生动物的饮食。可以查看粪便样本的DNA,通过对DNA进行测序,科学家可以找出野生动物的起源、遗传多样性。

可以将NGS用于微生物组分析,以确定某个地点中居民细菌、病毒种群的任何变化。当发生变化时,这意味着发生了疫情或病毒的变异,可以将其用作风险分析监控工具。

科学家的回归

人才流失一直是马来西亚的一个大问题。政府已经尝试了各种方法来留住优秀的学生,尤其是那些在科学,技术,工程和数学领域的学生,以便他们在马来西亚建立高科技产业。
马来西亚首席科学官甘翰明博士在澳大利亚一所大学建立了基因组学设施后两年多返回马来西亚。
甘翰明博士在学术界的只发表论文。但是他开始怀疑自己的做法。"我只是发表论文,并未真正使人类受益。那是我意识到自己需要摆脱学术界并寻找更多机会站出来做点实事"。
现在他希望与马来西亚年轻学子们分享对NGS的研究。

我想训练一支年轻的马来西亚生物技术专家队伍,他们可以正确地进行NGS并将其用于解决工业或学术界的问题。尽管这两个领域是不同的,但它们是相互联系的。”
“从对Covid-19新冠病毒进行测序等小项目开始,我想过渡到更大的项目,并利用这次机会培训年轻的科学家。我们需要传递科学、知识与真相。”


向真正的勇敢科学家英雄们致敬!!

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