你还因为meta分析不能评职称而烦恼?你还因为meta分析不能毕业而感到烦恼?现在不用担心了,SCI狂人团队有一招可以帮助你搞定这些烦恼。这一招是什么呢?那就是GEO数据挖掘。虽然TCGA、SEER、Oncomine数据挖掘很火爆,但是它们都是肿瘤数据库,只适合研究肿瘤方向的小伙伴,那不是研究肿瘤的小伙伴只能做meta分析吗?就没有做生信数据挖掘的份吗?答案是否定的。不研究肿瘤的小伙伴,可以做GEO数据挖掘呀 首先,我们来看一下GEO数据库是什么? GEO 数据库是美国生物技术信息中心(NCBI)的基因表达的综合库,是全球最大的基因芯片数据库之一。 接着我们来看一下,GEO有做什么? GEO有各种物种的各种疾病的芯片数据,数据类型非常多,例如mRNA,miRNA,lncRNA,SNP,CNV,methylation…, 海量的数据等着大家去挖掘。 最后,我们来看一下,GEO能做什么? 基因差异表达分析、miRNA分析,lncRNA分析,甲基化分析… 师资力量: SCI狂人团队,各位老师都擅长GEO、TCGA、SEER、Oncomine数据挖掘,meta分析,掌握 Linux,R,Perl等编程。 听课收获: 掌握GEO数据挖掘的基本操作。 适合人群:临床医生、医学研究生、博士。 课程目录: 一、从GEO上下载数据 二、数据初步整理 三、芯片数据预处理 四、选取差异表达基因 五、绘制火山图 六、绘制热图 课程内容展示: |
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