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R语言方差分析(ANOVA)学生参加辅导课考试成绩差异

 拓端数据 2020-12-01

原文链接:http:///?p=18087

方差分析是一种常见的统计模型,顾名思义,方差分析的目的是比较平均值。

为了说明该方法,让我们考虑以下样例,该样例为学生在硕士学位课程中的最终统计考试成绩(分数介于0到20之间)。这是我们的因变量 。“分组”变量将是学生参加辅导课的方式,采用“自愿参与”,“非自愿参与”的方式。最后是“不参与”(不参加或拒绝参加的学生)。为了形成组,我们有两个变量。第一个是学生的性别(“ F”和“ M”),第二个是学生的身份(取决于他们是否获得许可)。




> tail(base)PART GEN ORIG NOTE112 vol F R1 16.50113 non_vol. M R1 11.50114 non_vol. F R1 10.25115 non_vol. F R1 10.75116 non_vol. F a 10.50117 vol M R1 15.75

在开始多因素分析之前,让我们从单因素分析开始。我们可以查看分数的变化,具体取决于分组变量 



> boxplot(base$NOTE~base$PAR> abline(h=mean(base$NOTE),lty=2,col="re


我们还可以根据性别来查看 

> boxplot(NOTE~GEN,ylim=c(6,20))


然后,我们将估计两个模型。

第一个是约束模型。


> sum(residuals(lm(NOTE~1,data=base))^2)[1] 947.4979

对应于



> (SCR0=sum((base$NOTE-mean(base$NOTE))^2))[1] 947.4979

第二,我们进行回归,



> sum(residuals(lm(NOTE~PART,data=base))^2)[1] 112.5032

当我们与子组的平均值进行比较时,就等于查看了误差,



>> (SCR1=sum((base$NOTE-base$moyNOTE)^2))[1] 112.5032

费舍尔的统计数据



> (F=(SCR0-SCR1)*(nrow(base)-3)/SCR1/(3-1))[1] 423.0518

判断我们是否处于接受或拒绝假设的范围内 ,可以看一下临界值,它对应于费舍尔定律的95%分位数,



> qf(.95,3-1,nrow(base)-3)[1] 3.075853

由于远远超过了这个临界值,我们拒绝 。我们还可以计算p值



> 1-pf(F,3-1,nrow(base)-3)[1] 0

在这里(通常)为零。它对应于我们通过函数得到的



Analysis of Variance Table

Response: NOTEDf Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)PART 2 834.99 417.50 423.05 < 2.2e-16 ***Residuals 114 112.50 0.99---

或者







Terms:PART ResidualsSum of Squares 834.9946 112.5032Deg. of Freedom 2 114

Residual standard error: 0.9934135Estimated effects may be unbalanced

可以总结为



Analysis of Variance Table

Response: NOTEDf Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)PART 2 834.99 417.50 423.05 < 2.2e-16 ***Residuals 114 112.50 0.99---

我们在这里可以看到分数并非独立于分组变量。

我们可以进一步挖掘。Tukey检验提供“多重检验”,它将成对地查看均值的差异,




Tukey multiple comparisons of means95% family-wise confidence level



$PARTdiff lwr upr p adjnon_vol.-non_part. 0.60416 -0.04784 1.2561 0.07539volontaire-non_part. 6.66379 5.92912 7.3984 0.00000volontaire-non_vol. 6.05962 5.54078 6.5784 0.00000

我们在这里看到,“非自愿”和“非参与”之间的差异不显着为非零。或更简单地说,假设我们将接受零为零的假设。另一方面,“自愿”参加的得分明显高于“非自愿”参加或不参加的得分。我们还可以成对查看学生的检验,





Pairwise comparisons using t tests with pooled SD

data: NOTE and PART

non_part. non_vol.non_vol. 0.03 -volontaire <2e-16 <2e-16

如果我们将“非自愿”和“非参与”这两种方式结合起来,并将这种方式与“自愿”方式进行比较,我们最终将对平均值进行检验,





Welch Two Sample t-test

data: NOTE[PART == "volontaire"] and NOTE[PART != "volontaire"]t = 29.511, df = 50.73, p-value < 2.2e-16alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 095 percent confidence interval:5.749719 6.589231sample estimates:mean of x mean of y16.66379 10.49432

我们看到,我们在这里接受了“志愿者”学生的成绩与其他学生不同的假设。

在继续之前,请记住在模型中

在某种意义上说,与对应于同调模型  不依赖分组 。

我们可以使用Bartlett检验(该检验将检验方差的同质性)来检验该假设,请记住,如果p值超过5%,则假设“方差齐整性”得到了验证




Bartlett test of homogeneity of variances

data: base$NOTE and base$PARTBartlett's K-squared = 0.5524, df = 2, p-value = 0.7587

更进一步,我们可以尝试对性别进行方差分析的两因素分析,通常要根据我们的分组情况,也可以根据性别对变量进行分析。当均值的形式为零时,我们将讲一个没有相互作用的模型 

总的来说,我们的模型

其中,按实验处理方式表示与观察到的平均值平均值的偏差,而按组表示与所观察到的平均值平均值的偏差。这样可以通过添加一些约束来识别模型。

我们将进行手动计算,




Terms:PART GENRE PART:GENRE ResidualsSum of Squares 834.9946 20.9618 3.4398 88.1017Deg. of Freedom 2 1 2 111

Residual standard error: 0.8909034Estimated effects may be unbalanced

总结结果



Analysis of Variance Table

Response: NOTEDf Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)PART 2 834.99 417.50 526.0081 < 2.2e-16 ***GENRE 1 20.96 20.96 26.4099 1.194e-06 ***PART:GENRE 2 3.44 1.72 2.1669 0.1194Residuals 111 88.10 0.79---

由于实验组与对照组之间似乎没有任何交互作用,因此可以将其从方差分析中删除。



Analysis of Variance Table

Response: NOTEDf Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)PART 2 834.99 417.50 515.364 < 2.2e-16 ***GENRE 1 20.96 20.96 25.875 1.461e-06 ***Residuals 113 91.54 0.81---

从结果可以看到(自愿)参加课程会有所帮助。


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