在小菜园里进行作物的轮作虽有一定难度的，但是，没有菜园太小不适合作物轮作的，如果菜园太小，还可以每年两次给土壤施用堆肥以保持土壤健康，这对家庭花园中疾病的防御有很好的作用。
作物的轮作意味着将作物种植到菜园的其它地块，通过在不同季节之间轮换作物——甚至在同一季节，可以保存甚至增加土壤肥力。因为不同的作物对土壤中的养分需求不同，有的作物还能增加土壤中的养分。有些作物是喜肥性作物，生长过程中会大量汲取土壤中的养分甚至需要外界添加肥源，如：西红柿，西兰花，卷心菜，玉米，茄子，甜菜，生菜和其他绿叶作物等，但是有一些作物则会增加土壤中的养分，如：豌豆，豆类一些覆盖作物如三叶草类。有一些则是轻肥作物，在生长过程中对土壤中的养分要求不会很高，如胡萝卜，芹菜，茴香，香菜，莳萝，茴香，欧芹。
一个简单的轮作就是先在种植床上种植喜肥作物，然后在同一个种植床上种植些绿肥作物，再种植些轻肥作物。当然，这种轮作的前提是假设你有做够大的面积来轮作上面提到的所有植物。小菜园里的作物轮作相对来讲是比较困难的，假设你只有一个和两个种植床，在这种情况下，仍然可以将作物轮作到不同的位置，可以在种植西红柿之后种植豆类作物，或者你可以在春秋的时候轮作西兰花和豌豆，然后在夏季的时候种植其他豆类作物，当然还可以种植三叶草和紫云英等绿肥作物。
另外，除了轮作之外，向土壤中添加堆肥也能增加土壤中的养分，在种植季开始之前和收获之后，向种植床中添加大量的堆肥，堆肥也可以在作物生长的过程中的辅料。作物分组轮作是种简单的策略：轮作叶类作物，块根作物，和果实作物，但是分组轮作不是一种很准确的轮作方法，比如：辣椒属轻肥作物，西红柿是喜肥作物，但是两者都是果实作物，但是运用这种方法可以简单的将作物分组并很容易进行作物的轮作，一个简单的轮作计划如下：1、叶菜作物：包括卷心菜家族成员，如西蓝花，甘蓝，花椰菜
在这种作物轮作组合中，可以在果实作物之后种植覆盖作物，因为所有的果实作物几乎都是夏季作物——西红柿，辣椒，南瓜，甜瓜，茄子，他们在初秋就能成熟，在种植他们的地块上则可以种植冬黑麦，蚕豆，豌豆等冬季作物，在春季，覆盖作物也可以和叶类作物轮作，且能一直轮作下去。这组轮作如下所示：
同科作物轮作是一种最传统的轮作方式，尽管在一两个种植床上的小花园进行起来很难，在同科作物轮作中，来自同一科的作物不会经常在同一地点进行种植而是相隔每三年种植一次。家庭轮作不仅可以保持土壤的肥力，同时也是避免病虫害的最佳方式，特定的病虫害往往会袭击同一科的作物，通过作物的轮作，害虫很难找到他们想要攻击的植物。轮作是在花园的某一区域改变或交替作物的做法。通过轮作作物可以降低土壤中养分的损耗，并能防治和减少病虫害的累积。一般来说，作为喜肥作物一般都需要从土壤中获取更多的养分，可以与轻肥作物或豆类一起来进行轮作，通常情况下，如果相隔3-4年不在同一地块种植同一科属的作物，能最大限度的减少病虫害问题。洋葱，蒜类作物：大蒜，洋葱，韭菜，青葱，这些都是轻肥作物，可以在喜肥作物之后种植，在其之后还可以种植一些豆科作物。卷心菜类及十字花科蔬菜类：西兰花、抱子甘蓝，羽衣甘蓝，卷心菜，花椰菜，大白菜，水芹，大头菜，萝卜。这些都是属于喜肥型作物，可以在豆类之后种植这些作物，在种植这些作物之后的土壤上，可以种植一些覆盖作物如三叶草，或向种植过的土壤中加入一些堆肥，并在是适当的时候休耕一季。生菜，菊科：菊蓟，菊苣、生菜，这些都是喜肥作物，可以随着这些作物一起种植些豆科作物。谷物，禾本科：玉米，黑麦，小麦，可以接着种植番茄类茄科作物。豆科作物：豆类，豌豆，三叶草，紫云英，这些都是绿肥作物，种过这些作物的地块可以种植种植其他类任何作物。番茄，茄科：茄子，辣椒，西红柿，土豆，这些作物都是喜肥型作物，可以在禾本科作物之后种植这些作物，也可以在这些作物之后种植豆科作物，以回复土壤肥力。瓜类，葫芦科：黄瓜，甜瓜，夏季和冬季南瓜，西瓜，这些瓜类作物都是喜肥型作物，可以在禾本科作物之后种植，也可以在这些作物之后种植豆科作物，以恢复土壤肥力。胡萝卜，伞形科：胡萝卜，芹菜，茴香，香菜，莳萝，欧芹。这些都是中轻度喜肥型作物，这些作物可以跟随其他任何作物种植。附：第三届朴门种子秋播计划处于筹备阶段，如果你手上有老种子，欢迎你与我们一起传承老种子，播种未来。将老种子分享（有偿）出来与众多的朴友，种下去，我相信经过几年这样的分享接力，会有更多的人参与到老种子的保护和种植中来。
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