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推荐：江舜尧 编译：小鹿同学 编辑：小菌菌 荷兰格罗宁根大学及荷兰格罗宁根大学医学中心肠胃肝脏科的Rinse K. Weersma等人于2020年1月17日在国际顶级期刊Nature Communications发表题目为《Impact of commonly used drugs on the compositionand metabolic function of the gut microbiota》的文章，该研究报道了常用药物对健康人群及两种肠胃病患者的肠道微生物组成、代谢途径相关变化以及肠道中抗生素抗性机制等的影响，为当前临床背景下药物-微生物组之间的互作研究做出了贡献，并为进一步研究药物微生物学和当前处方药物潜在的肠道菌群引起的副作用提供了基础。
文章摘要
如今，人类肠道菌群已被报道与药物反应和功效相关，而这些药物中存在的化学物也会影响肠道菌群。但是，在多重用药和合并症相伴的临床背景下，药物-微生物之间的相互作用仍未被研究。本文中，研究者报道了常用药物和肠道微生物组之间的关系。研究者对来自健康人群队列和两种肠胃病队列的粪便样本进行了宏基因组学测序分析。按队列分析药物使用者和非使用者之间的差异，然后进行荟萃分析。尽管在41种药物中发现有19种与微生物的特征有关，但在控制多种药物使用时，质子泵抑制剂、二甲双胍、抗生素和泻药与微生物组的关联性最强。研究者在本文中提供了证据，证明与常用药物相关的生物分类学、代谢潜力和抗性组等的广泛变化。这证明了纠正多种药物使用的必要性，为将来的研究铺平了道路，同时对当前的微生物组研究产生了影响。文中重点图片说明： 
图1 | 按药物使用数量分层时，每个参与者的微生物丰富度（Shannon指数）。
图2 | 相关微生物特征的数量概述。
图3 | Methanobrevibactersmithii的相对丰度与口服类固醇有关途径之间的关联性。
图4 | 微生物促进嘌呤脱氧核糖核苷的降解途径。
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