背景介绍今天我们来学一下,如何使用FIJI或者ImageJ进行免疫组化图片的分析。 关于为什么这样进行分析,建议看一下这篇帖子ImageJ分析免疫组化图片,反正我是看的迷迷瞪瞪的,但是人家确实说的很有道理。反正都是相对定量的,也不是绝对定量。下来看一下是如何在软件操作的。 软件下载FIJI 本文教程1.找到需要进行分析的图片,直接拖拽进入FIJI 2.在这里,我们首先将图片转为8 bit图片 3.然后将灰度值转换为OD值:Analyze-Calibrate [为什么要转换成光密度来计算呢?因为如果用灰度来统计,纯白背景的数值为255,DAB着色如果越深,反而数值越小,这个和我们的认知刚好相反。因此,以光密度值来分析的话,背景纯白的值越是接近于0,DAB着色越深,光密度值越大,就是这样的方法更合理] 4.选择Uncalibrated OD,确定,就进行了相应的转换 5.在Set Measurements中设置需要测量的参数 6.选择Area,Integrated density,Area fraction,Limit to threshold这几个参数,确定 7.然后选择Image,Adjust,Threshold,进行面积选中 8.调节上下两个部分,使得需要统计的部分处于红色选中状态 9.然后点击Analyze-Measure进行面积分析 10.然后面积以及面积比就出来了 11.最终图片的平均光密度数值就计算出来了,为IntDen/Area=28109.526/73984=0.38 12.,怎么样,学会了吗? |
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