miRNA功能筛选与分析丁香园尽管目前在各种物种中发现了成千上万个miRNA,但已经鉴定功能的miRNA却少之又少。miRNA通常与靶基因m RNA3''UTR区发生相互作用,进而关闭或抑制基因的表达,30%的基因表达受miRNA调控,影响到细胞增殖,细胞凋亡,细胞分化 及相关信号通路等生命过程。锐博生物拥有高度自动化的高通量高内涵筛选平台,能够为您提供值得信赖的miRNA功能筛选服务。您只需要提供 miRNA名称及待研究的细胞系即可。?图1?miRNA功能筛选方法一、miRNA功能筛选方法高内涵筛选(HighContent Screening,HCS)是一种能够进行荧光显微成像和定量图像分析的自动化筛选技术,能够在细胞水平进行系统性定量分析,利用各 种荧光标记物(如Hoechst、GFP、荧光抗体等)来检测各类药物对细胞作用的多维信息,分析特殊分子靶位和生物特征,是药效结构发现 、药物靶标确认、RNAi筛选、药物先导物优化和药物毒性评价的技术平台。?二、miRNA功能研究工具:1)???miRNAmim icmicrONTMmiRNAmimic是运用化学方法合成的miRNA模拟物,能模拟细胞中成熟miRNA的高水平表达,以增强内 源miRNA的调控作用,进行功能获得性(gain-of-function)研究。2)???miRNAinhibitormicr OFFTMmiRNAinhibitor是化学合成的,经过特殊修饰的miRNA抑制剂,通过特异性地与成熟miRNA分子结合而抑制 其作用,可以削弱细胞中miRNA导致的调控作用,从而进行miRNA功能缺失性(loss-of-function)研究。可以用来筛选 miRNA靶位点,筛选调控某一基因表达的miRNA,筛选影响细胞生长、增殖等过程的miRNA。3)???miRNAagomir micrONTMmiRNAagomir是经过特殊化学修饰的miRNA激动剂,通过模拟内源性miRNA进入miRISC复合物来调 节靶基因mRNA的表达而发挥作用。与普通的miRNAmimic相比,miRNAagomir在动物体内具有更高的稳定性和miRN A活性,更易通过细胞膜,组织间隙而富集于靶细胞。在动物实验中可以用全身或局部注射等方法进行给药,作用效果持续时间可长达6周。4)? ??miRNAantagomirmicrOFFTMmiRNAantagomir是经过特殊化学修饰的miRNA拮抗剂,通过 与体内的成熟miRNA竞争性结合,阻止miRNA与其靶基因mRNA的互补配对,抑制miRNA发挥作用。miRNAantagomi r均为miRNA成熟链的反向互补序列,全链进行甲基化修饰,在5''端和3''端分别有2个和4个碱基硫代修饰,并在3''端连接有高亲 和性胆固醇修饰。与普通抑制剂相比,micrOFFTMmiRNAantagomir在动物体内外具有更高的稳定性和抑制效果,更易通 过细胞膜、组织间隙而富集于靶细胞。miRNAantagomir在细胞实验中转染效率更高,甚至不需要转染试剂,从而避免了转染试剂包装 过程的复杂步骤及其对实验的影响。在动物实验中可用全身或局部注射等方法进行给药,作用效果持续时间可长达6周。三、miRNA功能分析方 法1)miRNA过表达选择依据2)miRNA抑制方法的选择3)基因表达谱芯片miRNA通常与靶基因mRNA3''UTR序列发生相 互作用,导致关闭或抑制靶基因的表达。由于miRNA作用方式的特殊性,其可能与多个基因发生调控作用,进而影响到其他基因的表达变化。基 因表达谱芯片可以大规模、高通量地分析各种生物过程变化中基因表达变化的全面信息。锐博生物采用先进的原位合成技术可高质量地合成数以万计 寡核酸探针,系统全面地分析基因表达谱变化,可以依据客户的需求定制感兴趣的任何基因组合表达谱芯片,亦可定制已知基因组任何物种(包括但 不限于大猩猩、恒河猴、马、牛、狗、猪等动物,大豆、花生、水稻、大麦、高粱、玉米、甘蔗、葡萄、拟南芥等植物,鸟类、鱼类、昆虫类、微生物以及各种病毒等)的基因表达谱芯片。?图2采用基因表达谱芯片分析miRNA功能 |
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