专题笔谈|肺部/肠道菌群与疾病预后

导语：肺微生物群是侵袭性肺曲霉病风险患者临床变异的一个尚未被充分研究的来源，其作为呼吸道真菌疾病诊断和治疗靶点具有一定的潜力。肠道微生物群的组成与健康人群显著不同，其特征似乎对患者的180天死亡率有影响。肠道微生物群分析有望预测未来结果。

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肠道/肺部菌群

• 肠道/肺部菌群：生存在人的肠道/肺部中的细菌构成的集体。

• 大量研究表明肠道微生物与包括心血管、肿瘤、神经、消化、呼吸系统等多种疾病的发生发展密切相关。

• 肺部菌群研究逐渐增多。多种呼吸系统疾病患者可见肺部菌群失调；肺部菌群特征和某些疾病病情进展、预后相关。

从2010年开始研究，2015年后逐步上升，2019年最高达157项。

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• 比利时鲁汶大学医院。

• 时间：2013年至2018年。

• 人群：临床怀疑感染的免疫功能低下患者；分为IPA组和非IPA组。

• 研究性质：前瞻性单中心观察性研究。

• IPA发病时的细菌多样性程度可以预测感染患者的生存。

结果1：IPA改变了肺微生物组的组成和多样性

图1  IPA患者的肺微生物组发生改变

结果2：IPA患者表现出特异性菌群丰度的差异

图2  IPA影响选定细菌类群的丰度

结果3：IPA肺微生物组与肺免疫改变相关

图3  中性粒细胞计数影响肺微生物组

注：中性粒细胞数量（A）而不是淋巴细胞（B）数量有明显的梯度，表明根据中性粒细胞计数，肺微生物组的整体组成发生了变化

图4  IPA富含的细菌分类群与炎症增加有关

结果4：肺微生物组的多样性预测IPA的结果

图5  肺微生物组的多样性IPA的存活率

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• 南方医院神经重症监护病房。

• 时间：2016 年 12 月至 2018 年 2 月。

• 研究性质：前瞻性观察性研究。

• 格拉斯哥昏迷量表（GCS）<11分且预计ICU住院时间>48 h的神经重症监护病房成年患者符合纳入标准；对照组：性别和年龄匹配的健康人群。

• 这些患者的肠道微生物群组成与健康人群显著不同，并且这种失调程度在神经重症监护病房住院期间增加。肠道微生物群特征似乎对患者180天死亡率有影响。

结果1：患者人口学统计情况

图1  神经重症患者特征

结果2：神经危重症患者与健康受试者肠道菌群特征的比较

• 神经ICU患者和HC之间的β-多样性和α-多样性有显著差异（原文未列图）。

• 作者使用线性判别分析比较了两组之间在丰度上有显著差异的物种。

• 门水平上，神经ICU组中的变形菌门、去铁细菌门和疣微菌门的相对丰度高于HC组。

• 在科水平上，神经ICU组富含肠杆菌科、卟啉单胞菌科、肠球菌科、疣微菌科、理肯菌科和乳杆菌科。

  
  

图2  肠道微生物群丰度面积图

结果3：神经重症监护病房住院期间肠道菌群组成的变化

图3  神经重症监护病房患者肠道菌群的动态变化

6个高丰度分类群与采样时间之间的相关性分析

图4  神经重症监护病房住院期间特定分类群的动态变化

在门水平上，厚壁菌门与样品收集时间呈负相关。

在科水平上，瘤胃球菌科和毛螺菌科与住院时间显著相关。肠杆菌科与住院天数的相关性呈显著性趋势。

结果4：肠道微生物群丰度与180天死亡率之间的关联