【原】手机ImageJ测心率

于是细细去看，竟是大名鼎鼎的ImageJ。ImageJ是什么呢？是NationalInstitutes of Health（NIH）开发的一款免费的、功能强大的图像处理软件，在科研中应用极为广泛。不用介绍了，介绍就是百度的平方、立方……

ImageJ是一个主流的工具，很容易找到学习资料。于是看着知乎上一个专栏的教程，先尝试一个手机测心率，结果极其准确。

1.下载ImageJ。ImageJ有两种版本，一种干净清爽的ImageJ本身，地址为https://imagej./ij/download.html，另一个是FiJi，地址为https:///software/fiji/downloads，它们的差别是ImageJ的功能比较少，于是FiJi是人们把各种功能插件放在一起，重新包装的。

2.录制心跳视频。拿起来手机，打开相机，用无名指挡住摄相头，这时手机屏幕上是一片肤红色(自己还有多少胶原蛋白，心里没点儿数么？)。录制10秒视频。这个视频其实是一亮一暗、一亮一暗随心跳变化的，但是肉眼看不出来。

把视频发送到电脑(压缩成压缩包再传，别用微信、QQ等直接传，它们会把视频文件重新压缩和处理，有些重要的参数会变化)，看看帧率，一会儿要用。

3.打散视频文件为图片序列。用Tracker打开录制的视频，然后导出为jpg序列。说明一：FiJi(ImageJ)通过FFmpeg插件是可以直接导入mp4格式视频的，但是我安装这个插件安装了N次没有成功，提示N多错误。说明二：使用Tracker打开mp4、mov是Tracker的常规操作，也不算麻烦，但却增强了ImgaeJ的通用性。这样想开了，就不再想着安装FFmpeg了。

4.导入图片序列。File/Import/Image sequence...

5.提取图片序列中间段。Image/Duplicate...选取要提取的部分首、尾帧，注意勾选Duplicate stack，就是确定之后会重新复制一份新的序列，而不会在原来的图片序列上折腾。

6.提取图片序列的基础数据(Profile)统计图。用方框工具选图片比较中间的部分，再Image/Stacks/Plot Z-axis Profile，得到统计图。再用point描点工具把各曲线峰标出来。

7.得到曲线峰的数据表。Analyze/Measure，得到各峰值统计数据表，这个表能被保存成csv格式。

8.计算心率。到Excel里打开统计数据表，其中X的含义是这些峰值们相距的帧数(因为和时间是对应的，所以带有小数部分)，Y值其实就是光强度的意思。

在I9、I10、I11输入相应公式，计算得到心动周期0.8929秒，心率67次/秒。按住手腕桡动脉，打开手机秒表，屏住呼吸，数脉搏，发现正好67次。