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BMS-986251;路线设计;工艺优化
2022-05-24 | 阅:  转:  |  分享 
  
BMS-986251:路线更新,多氟基团引入和五元环构建,敢设计就会创新,收率提高5倍参考文献:https://doi.org/10.102
1/acs.oprd.1c00338Org.ProcessRes.Dev.2022,26,592?600最初路线1
0步反应获得关键中间体10依次经加成消除,氧化硫醚,迈克尔加成,构建离去基团,关环,保护基,格氏试剂引入羧基,引入多氟,构建单氟,
脱Boc。五元环构建过程,环拆分控制手性,收率低。引入多氟基团,碘代物先格氏试剂深冷制备羧基,再低温引入两个三氟基团,再引入单氟,
路线长,条件苛刻。新路线的策略直接引入多氟化合物H经硼酸中间体,进行偶联策略收率仅30%。文献调研,苯胺和多氟碘代物直接在硫代硫酸
钠等条件下,进行氨基对位的偶联。文献扩展,先构建化合物3,然后引入多氟。采用对氟苯磺酸钠和碘,在三乙胺条件下,直接引入苯磺酰基,避
免了最初路线oxone氧化步骤,收率65%。化合物3,以Onishi条件,Na2S2O4溶液,?(CF3)2CFI,and1
MNaOH在MTBE中获得位置选择性好的化合物5,收率70%。三环构建迈克尔加成底物化合物5经硼氢化钠还原,然后经OMs消除可
得化合物7。手型侧链氯乙醛和手性叔丁基亚磺酰胺作用后,硼氢化钠还原可得侧链8b。三环构建经过碱和温度的筛选,初步确认了特戊醇钠,零
下40的条件。虽然化合物9可分离,实验发现一锅法脱保护更好一些,采用TMSCl和甲醇可以得到化合物10的盐酸盐,但是盐酸盐吸湿,改
用L-酒石酸更好。最终的路线为工艺优化化合物3的优化优化了碱,加料方式,溶剂,氧气等参数,确认了工艺参数,收率75%。底物化合物1
对氧气非常敏感(β-四氢萘酮对氧化敏感)。化合物6的优化MTBE衍生杂质5a和5b的解决,改变溶剂反应转化差,继续采用MTBE,同
时可以加酸解离回收产品。还原采用硼氢化钠可得化合物6。虽然化合物5可以分离,但是一锅法更高效。化合物10的优化初期采用MSCl,经
消除构建双键得到7,反应也很好,改为三氟乙酸酐,有助于一锅法的实现。构建离去的三氟乙酸酯6a,叔戊醇钠消除形成双键7,直接降温,和
化合物8b发生关环反应得到9。采用甲醇/三甲基氯硅烷脱除保护10,甲醇速率快,因可以有效和副产物磺酰氯反应。最后成L-酒石酸盐,收
率高,选择性好。新旧路线数据对比收率提高了接近5倍,PMI是原来的1/8,路线变短,分离变少。BMS-986251合成中:三环合成
的工艺优化和杂质谱研究BMS-986251是百时美施贵宝研发的可逆BTK抑制剂,正处于临床级阶段。其逆合成分析如下:硫醇4和酮5经
缩合氧化得到化合物7经氨基乙醇加成和环化得到三环构建带氟官能团得到化合物2和化合物3缩合,水解得BMS-986251。1:化合物6
乙烯硫醚的合成化合物4和化合物5缩合制备乙烯硫醚6氯化氢气体条件,硫缩醛杂质12占20%以上,未采用四氯化钛脱水条件研究小试阶段0
.8kg数据,乙烯硫醚6和硫缩醛12比例大约9:1,放大到50kg时,尽管乙烯硫醚6和硫缩醛12比例提高,但是原料4剩余很多,而且
双硫杂质13很大,杂质14也变大了。推测双硫杂质13是硫醇被氧化产生推测杂质14是双硫杂质13和乙烯硫醚6反应后,水解产生。实验研
究:把硫醇5的THF溶液暴露在空气中,2h后,双硫杂质13占20%。实验研究:把双硫杂质13和乙烯硫醚6,加入到有三乙胺的THF中
,搅拌一段时间,加水,产生了杂质14。四氯化钛条件没有得到较理想的数据,改尝试对甲苯磺酸脱水对甲苯磺酸及其吡啶盐条件对甲苯磺酸吡啶
盐的脱水原理和对甲苯磺酸一样,有的底物不能和对甲苯磺酸共热脱水,可选择对甲苯磺酸吡啶盐。有点像吡啶盐酸盐脱甲氧基。回流不分水,反应
时间长,60hrs,比例约10:1回流分水,时间大约24小时50kg代表性批次数据如上图,比四氯化钛条件好2:化合物7的合成乙烯硫
醚6产品不分离,Oxone氧化后,重结晶可去除大部分杂质。主要杂质是过度氧化杂质16。3:化合物10的合成优化中间体的不稳定性和难
于分离的特点,从化合物7制备化合物10采用一锅法Aza加成制备化合物8氨基乙醇和化合物7的反应是可逆的,无论是多加氨基乙醇还是延
长时间,化合物8最多占有85%如果后处理遇到水,化合物8会变成化合物7一锅法策略制备化合物9不分离的化合物8直接构建离去基团OMs
采用MsCl的主要杂质是氯代杂质17和吖啶杂质18。改用Ms2O代替MsCl,可以避免氯代杂质研究发现后加碱的加料方式(entry
1和2),有利于杂质18产生同时滴加碱和Ms2O的(entry4)可以抑制杂质18化合物9稳定性不好,对pH值敏感。ph值小于
6,走反氮杂加成,再生化合物7ph值大于9有利于产生吖啶杂质18。直接关环制备化合物10采用三乙胺,DBU,DIPEA有利于产生吖
啶18采用金属碱,叔丁醇钠钾,可以有效抑制副产物18,可能是软硬酸碱理论,金属碱可以优先拔苄位的氢,有利于进攻磺酸甲酯碳关环。酒石
酸拆分得到构型单一的化合物1020-70%水有利于拆分提高ee值小结:苯硫醇非常容易被氧化成双硫杂质,工艺优化中一定要注意硫醚容易
被氧化成亚砜,甚至砜,工艺优化中也一定要注意关环过程有机胺的碱和有机金属的碱,结果不同,有机金属碱有时能形成螯合物,反应选择性好甲
磺酰氯制备OMs,氯代杂质产生途径是,反应释放的氯离子进攻OMs导致,工艺中要研究拆分不能忽略水的作用,一定要记住不稳定的,难于分
离的,要采用一锅法,ICHQ11问答文件也解释了,可以多步不分离。BMS-986251合成下:多氟结构的引入和API合成1??直
接构建多氟结构策略化合物10先保护氨基得到化合物11,再和多氟化合物19直接偶联,转化率低或者无转化。2??逐步构建策略构建羧基化
合物11在格氏试剂作用下,与二氧化碳气体在低温下反应,引入羧基得到化合物23,主要杂质是碘消去杂质24。非压力模式,放大到23kg
,收率92%非压力模式,7eq.格氏试剂,大量的二氧化碳,通过控制二氧化碳的底部通入量来控制热量中等压力模式,3kg,收率86%中
等压力模式,5eq.格氏试剂,减少二氧化碳使用深冷条件的使用,二氧化碳气体的使用以及压力的使用,同时热量的释放,该步工艺条件未来将
会被淘汰尝试过用碘代物,经偶联反应引入氰基,然后水解氰基得到羧基,路线没有打通构建6氟羧基和CDI作用得到活性中间体25,TMSC
F3作为亲核试剂,在低温下和化合物25反应得到化合物27。使用大过量(10eq.)TMSCF3,才能使化合物26转化成化合物27工
艺需要大量的带氟试剂,包括TBAF,成本很高构建7氟筛选了一系列氟试剂,同时研究了碱对反应的影响,最后选择了XtalFluor-E
(DAST氟硼酸盐;)和DBU组合(Entry7)。备注:XTALFLUOR-M二氟-4-吗啉基锍四氟硼酸盐;DAST氟硼酸盐
;)扩展:市场上还有应用比较广泛的氟化试剂Selecfluor是商业化试剂,用于氟代反应,其合成路线如下:DABCO和二氯甲烷先
制备铵盐1然后和四氟硼酸钠反应得到化合物2,副产物氯化钠化合物2和氟单质/四氟硼酸钠反应得到selectfluor试剂3,氟化钠析
出。3??API的合成API的合成都是普通常见的反应,采用T3P进行酸胺缩合得到化合物28,没有发现消旋异构化杂质产生异丙醇为溶剂
,氢氧化锂水解苯酯得到API,副产物苯酚和杂质29可以经结晶分离去除杂质29来源是异丙醇和芳基氟,碱性环境下,发生了SNAr反应酸
化处理水解反应过程,产生了杂质30(羧基和异丙醇酯化),控制体系pH值可以避免杂质30合成了11kg的API小结这是一个很难的工艺
,部分反应条件是不理想的,PMI很高,随着工艺的持续研究,工艺还会更新。期待中...格氏试剂交换法制备格氏试剂是个不错的选择氟代反
应相对较少,氟试剂种类也是有限的,可以收藏一下DBU和DABCO有时候作用不仅仅是碱,也不一定要用当量T3P酸胺缩合,pH值对于含
磷副产物的形式有影响,不同形式溶解度不一样,影响后处理和残留工艺后处理永远不要低估pH值因素,不仅会影响杂质,还可能影响过滤速率等
四、BMS-986251合成:1,4-环己烷二羧酸酯合成BMS-986251是百时美施贵宝研发的可逆BTK抑制剂,目前正处于临床试
验级阶段。其逆合成分析如下:以化合物6为原料,构建手性中心,制备化合物5;偶联构建羧基苯酯,合成化合物3;化合物3或4与化合物2进
行酸胺缩合,并水解酯基得到BMS-986251。第一代路线化合物7和化合物8,经两步反应得到带有叔丁基的哈格曼酯10分离拆分得到化
合物11,经氢气还原得到化合物12构建OTf离去基团,插羰引入羧酸酯14不对称还原得到化合物15水解叔丁酯得到关键片段化合物4和化
合物2缩合,并水解得到API上述合成路线存在的问题:合成化合物4的整个过程,每步的中间体产物吸收差,不利于分析方法开发和优化研究插
羰时使用了CO有毒气体化合物4合成中,各个中间体都是油状物,不利于纯化手性拆分的成效很低改变路线哈格曼乙酯6为原料,先还原得到16
,酶水解得到构型单一的化合物17三氯氧磷/叔丁醇/吡啶条件下制备叔丁酯12构建离去基团OTf,采用甲酸苯酯构建羧基酯21不对称氢化
得到化合物22水解叔丁酯得到关键片段化合物3与化合物2缩合,然后水解得到API本条合成路线的优势:哈格曼乙酯6为原料,采用酶催化得
到单一构型,避免拆分甲酸苯酯代替CO,避免有毒气体的加压使用引入苯酯,有利于HPLC分析引入苯酯,游离结晶分离变得容易水解苯酯条件
更温和3.6kg规模化合物12的合成优化H2SO4/MgSO4/t-BuOH条件,转化率30%DMAP/Boc2O/t-BuOH条件,转化率63%,比例2.8:1?三氯氧磷/吡啶/条件,收率85%,手性杂质化合物20的含量低于0.5%小结酶催化的使用,随着酶化学的发展,会越来越广泛;但是,当前阶段酶催化的优化成本很高,催化剂太贵;引入苯基的策略很好,一石三鸟,不仅有利于HPLC吸收,也有利于结晶,也可以避免CO的使用;羧酸叔丁酯的合成不是很容易,控制不发生消旋更不容易,文献采用的条件值得收藏在大脑里。
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