Comparative genomic hybridization (CGH) or Chromosomal Microarray Analysis (CMA)
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阵列比较基因组/杂交基因组分析技术是一项新技术,它比传统的细胞遗传学技术能够对整个基因组进行更为详细的分析。 传统的细胞遗传学可以检测大于5Mb 的 DNA 数量变化。利用分子遗传学技术,我们可以检测到 DNA 序列中一个碱基对的变化,但是必须提前确定目标区域或基因才能做到这一点。 微阵列结合了传统分子和细胞遗传学的特点,可以进行整个基因组筛选,但能够检测小于5Mb 的变化。这允许检测微重复和/或微删除的精确边界。反过来,这些片段中的特定基因可以被识别,这可能具有临床意义。 用荧光染料标记样本和对照样本的 DNA,然后与寡核苷酸杂交。结果分析使用定量成像方法和分析软件,以协助确定每个目标 DNA 序列丢失的拷贝数,增加的拷贝数,或正常拷贝数。 该技术已在已知微缺失/重复和其他传统细胞遗传学方法检测的不平衡核型患者中得到验证。 CMA 不会检测到低水平的镶嵌、平衡易位或反转。 任何具有畸形特征、不明原因的智力迟钝/发育迟缓、非遗传综合征特有的先天性异常、癫痫、语言迟缓、多次流产、肿瘤分析以帮助诊断以及任何具有正常染色体分析的患者,都可以获得 CMA。 方法: 阵列比较基因组杂交分析400k探针 目的: 临床诊断、科学研究
一个典型的用于最常见的染色体异常的阵列CGH分析步骤
这个图显示了 BAC 数组计算全息图的步骤。(1)从基因组物理图谱中选择 BAC 克隆。(2)从选定的 BAC 克隆中提取 DNA 样本,并通过 DNA 指纹或序列分析分析进行鉴定。(3)多步放大过程从每个克隆产生足够的材料用于阵列定位。每个克隆都被复制到一个坚固的支撑体上。(4)用花青3和花青5差异标记参考 DNA 和试验 DNA。(5)将两种标记产物组合并杂化到带斑点的载玻片上。(6)通过两通道扫描获得杂化载玻片的图像。来自单个斑点的信号强度比可以显示为一个简单的图(7)或使用更复杂的软件,如 SeeGH,它可以显示整个基因组的拷贝数改变(8)