|
自2019年被Nature期刊评为最值得期待的生物技术之一以来，单细胞测序技术一直被认为是文章和课题中的高端技术。谁都想自己的课题里能有单细胞分析的图。 但自己样本测序价格又很贵，用公开的单细胞测序数据吧，又不会代码...
今天和大家介绍一个在线可以零代码，鼠标点点点就可以实现“高大上，公司动则大几千”的单细胞分析。 首先进入到官网www.aclbi.com，首页可以看到很多功能模块，我们选择单细胞Single Cell。
这个工具整理了GEO数据库里公开的的单细胞数据，可对样本进行可视化的样本选择，再分组，数据预处理，分群鉴定，组间或细胞群之间分析等，全程无需任何代码基础，鼠标点点点就可以高清出图和对应的原始数据。全程按照顶部导航栏按步骤操作就行啦。很贴心，每一步都会有视频介绍。 第一个框是样本选择，输入框里输入关键词，就可以搜到感兴趣的单细胞数据了。
比如，标题搜索乳腺癌，就是乳腺癌的单细胞数据，然后点看样本，就可以看到单个样本，然后选中，就可以将其保存至我的样本库用于后期分析了。
第二个框是数据预处理，主要用于细胞质控，批次去除。可以默认参数，也可以根据意见调整。
第三个框就是开始分群鉴定，主要细胞群图分析，寻找每个cluster的Marker基因以及细胞群重命名。
最后的两个框就是根据重命名后的细胞群进行各种分析啦，比如看不同分组的细胞比例差异、某个基因在不同细胞群的表达（x基因在T细胞，B细胞之间的差异），不同细胞的Hallmark通路表达差异，不同细胞的代谢差异等等。
怎么样，以上公司要大几千的单细胞分析，这个网站全部都可以鼠标点点完成哦，高清分析图，原始数据都有啦。 分分钟实现单细胞自由 弗雷赛斯 -浙江大学硕博创建于2015年 让天下没有难做的科研--联系我们:freescience@zju.edu.cn |
|
|
