【原】基础科研思路及方法学阶段性总结 Version2022

     当用键盘敲下“基础科研思路及方法学阶段性总结”的时候，我们是没有底气的，因为我们目前仍然处于一个“探索和学习”的起步阶段，所以就又在标题后面加了“Version 2022”，给今后的改进留了余地（后面还会有Version 2023, 2024......）。今天，我们结合自己的局限的经历，跟大家分享一下医学基础科研学习过程中的大方向和小细节，也请大家带着包容的态度阅读。

        由于我们之前在B站上对很多内容进行了相对细节的分享，所以今天我们主要是对上述内容进行有机的“串联”，整体分为以下四个部分：基础科研学习指南、经典的基础科研套路、常用的基础实验技能、组学与基础科研。

一、基础科研学习“指南 ”   

        斯以为，阅读这篇文章的，主要是仍在求学阶段的学术型研究生们（当然，若不是，只要是医学生，都可以继续看下去），所以有必要跟大家分享一下，我们在研究生阶段，可以沿着什么样的大方向前行（这个方向不一定是唯一正确的方向，但是应该是可持续发展的方向）。

        1.研究生阶段，应当可以算是我们人生中的完成知识积累的一个关键时期，所以“学习”仍然是这个阶段的主旋律，不可偏离这个主线，而且在这个智力和精力的黄金时期，还要做到“系统”。2. 系统性学习固然重要，我们需要有一个意识：这个过程不是一蹴而就的，需要长期的积累，需要阶段性的提升，不可过于焦躁。3.不论你具体是什么专业（临床医学、基础医学...），在研究生期间，需要尝试一个习惯——沉浸式思考，即对一个科学问题，需要在研究背景、设计、方法、结果等多个层面进入深入的思考，切忌虚浮。4. 医学科研知识固然重要，但不可局限于该领域。

（附上B站原视频，若有时间，大家可以观看）

二、经典的基础科研套路

      科研群体一直在思考，做基础科研，应该怎么做？说实话，这个问题我们也一直在探索，至今也只是一知半解，今天只能把我们目前的认知分享给大家，如果大家有好的想法与建议，也可以在评论区交流。

      我们主要从三个方面跟大家分享：基础科研关注的主体（表型）、基础科研方法的进步（变）、基础科研的底层逻辑（不变）。

        2.1 基础科研关注的主体——表型

        做临床科研的同道们应该深有体会，临床科研关注的主体是疾病，涉及疾病的预防（防）、诊断（诊）、控制（控）、治疗（治）、康复（康）。相比之下，基础科研关注的直接主体并不是疾病，而是表型。疾病与表型之间，并不是一一对应的，而是相互交织的，比如冠心病这一种疾病同时伴随有炎症、纤维化、氧化应激、细胞凋亡等多种表型，而炎症这一种表型可以存在于冠心病、高血压、瓣膜病等多种疾病。

        因此，我们在介绍自己的具体研究方向时，简单来说，就是疾病+表型（基础科研的二维定位系统），如冠心病的炎症机制。

       2.2 基础科研方法的进步——变

        基础科研发展到今天，我们可以看到层出不穷的新技术，尤其是随着高通量测序时代的到来和普及，让基础科研从以往的“明星分子”时代，逐渐进展到Bulk组学时代、单细胞测序时代、空间组学时代。我们不难想象，以后会有更新的、让人眼花缭乱的技术涌入我们的视野。而全球的科研人员，也会利用这些新技术，不断地去验证旧知识，或者发现新知识。

       2.3 基础科研的底层逻辑——不变

       变化总是让人恐惧，而不变才能让人心安。那在医学基础科研这个领域，什么东西才是不变的呢？当然，没有什么东西是绝对不变的，但是在近几十年，基础科研的底层逻辑，应该是不会大变的。在提及基础科研的底层逻辑之前，我们需要明确一个论点：分子才是基础科研的主角。基于此，我们会发现，实际上基础科研一般都是围绕着3个方面在进行：发现分子靶点→证明分子功能→解释分子机制。这就是基础科研的底层逻辑。

三、常用的基础实验技能

       一个经典的基础科研项目至少需要下述条件：严谨的研究设计、扎实的基础实验技能、有逻辑的写作和赏心悦目的图表。其中，基础实验技能的培养是研究生前期的重要内容。但是我们也需要意识到：基础实验种类繁多，我们没有办法做到熟练掌握每一项技能，但是我们至少需要常用的实验技能（如细胞层面的细胞培养，RNA层面的qPCR, 蛋白层面的WB, IHC, IF等），同时知晓其他实验的大致原理和目的（如Elisa, 流式细胞术等等）。总体来说，还是需要结合自己的课题需要，来决定需要熟练掌握哪些实验技能。