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感谢吉林大学生命科学学院博士、吉林药学院孟老师提供的NCBI使用心得 NCBI官网 https://www.ncbi.nlm./ 打开页面后如图
点击下黑色下三角 主要三个重要选项Gene,PMC,Pubmed PMC 是下载文献的里面所有文献都是免费的，适用于我这种没订阅期刊网的。 Pubmed 适用于你下载文献。 主要教你Gene 一、在Gene后面对话栏中，输入你感兴趣基因或者蛋白eg LOX1点击 search 跳出对话框如图
搜索出很多这种蛋白。 1 确定这是你需要的蛋白。 2 注意观察后缀，红色圈部分，给出了你基因所在物种信息。选择你需要的物种，如人 Homo sapiens(human)或小鼠，大鼠，斑马鱼等。 二、在确定是你关心的基因（物种和基因缩写都对）后，点击该基因ID如下图红圈部分。
进入新界面。 三、进入新界面后，会有很多信息需要注意， 1 首先是该基因的一些信息，还有其他常用名，比如下图红色部分。 本来这个基因官方缩写是OLR1，但是它也叫做LOX1.
2 下拉网页，这里说明它位于12号染色体上。
3 下拉网页到这里如图。
红色圈，绿色圈，蓝色圈都可以点击进去获得蛋白，还有核酸的全部信息。 其实万变不离其宗，点红，绿，蓝三个圈中哪个都能获得你想要的基因背景信息。 比如点击红色的，会进入新的界面。 GenBank.1 教育GenBank页面使用，点击红框，GenBank 刷新页面，下拉网页至这里
这里说明这个基因在12号染色体上，全长13892. GenBank.2 下拉网页到这里
1-190,3017-3118等等这些都是mRNA的外显子，这个基因是由6个外显子构成的。 就是红色方框内的信息。191-3016属于DNA的内含子部分。它在转录成mRNA后被剪切掉不翻译了。 这个蛋白LOX1整体是由6个外显子合并而成的，但是蛋白分成不同亚型。不同亚型是由不同外显子拼接的，举个例子1亚型由1,2,4,5外显子组合，2亚型由1,2,3,6组成等等。 GenBank.3 下拉网页到这里
这里是CDS区，它是外显子内部分，是mRNA中翻译蛋白的部分。 你看那这也是6个外显子。轻重3017-3118,5235-5480,11267-11406,11730-11845 也就是外显子2,3,4,5跟mRNA完全一致。 不同的是1,6外显子比mRNA短。比如mRNA 1外显子是1-190，CDS 1外显子是115-190（这段就是信号肽序列，起始密码子Met）。其中1-115是mRNA不翻译蛋白的结构部分，如核糖体结合部位。同理mRNA 6外显子是12171-13892，CDS 1外显子是12171-12312。其中12321-13892是mRNA不翻译蛋白的部分如ployA。 介绍概念CDS，CDS不同于ORF CDS从mRNA第一个其实密码子开始AUG到最后终止密码子TAA（TGA,TAG）终止，核酸序列是准确表达蛋白序列。ORF随意只要有AUG及开始一段核酸序列。 举个例子如这段序列 UUG AUG TAG ATG TAU GGC TCC UAG TAA 蓝色字部分是CDS 也可以称作一段ORF， 下划线可以叫做另一段ORF。 GenBank.4 下拉网页至如下部分如图
这是该基因DNA全序列 GenBank.5 上拉该网页至上部如图位置，点击蓝色圈框部分“highlight”就可以知道DNA上哪些是RNA部分。点击后页面刷新，DNA部分发生改变如图。
CDS区被褐色背景了，同时给出蛋白序列。 以上就是GenBank教学。学会了你就能掌握不同mRNA所在DNA位置跨了多少bp内含子，便于realtimePCR 引物设计，防止DNA污染。Realtime PCR引物最好跨越一个1000 bp内含子，并且mRNA片段长度100-200bp。防止DNA污染。 4 回到初始NCBI页面，下拉菜单至
如图，下面就是LOX1蛋白的一些异构体，如isoform2,isoform1,isoform3等。 NM001172632.1点击里面是LOX1异构体1 的（isoform1）mRNA序列
点击highlight刷新网页，就能得到蛋白序列，及翻译蛋白的CDS区。同时给出蛋白序列。 NP001166103.1 点击里面是蛋白序列，刷新网页就可以得到蛋白序列 如图
5 最后还有个值得学习的地方 回到原始界面点击如图红圈部分“CCDS53745.1”
这里面就是该异构体isoform2里面的546nt的CDS区和181个氨基酸的蛋白序列。
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