miRNA数据库简介及miRNA靶基因批量预测 课程网址: https://www.bilibili.com/cheese/play/ss7477 课程二维码: 长按二维码跳转 本课程一共包含13节课程, 1.第一节,介绍miRBase数据库,以及如何从miRBase数据库下载miRNA数据 2.第二节,介绍miRTarBase数据库 3.第三节,介绍miRcode数据库 4.第四节,介绍starbase(ENCORI)数据库,以及利用starbase预测miRNA-mRNA之间调控关系 5.第五节,利用starbase预测miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间调控关系,以及其他RNA-RNA之间相互调控关系,还有ceRNA网络鉴定。 6.第六节,介绍starbase的pancancer功能,如何画基因表达箱型图,生存曲线以及表达相关性散点图 7.第七节,基于starbase所有的预测结果(已经帮大家下载好了人和鼠的所有预测结果,可以直接使用),利用R代码批量预测miRNA-mRNA之间的调控关系 8.第八节,基于starbase所有的预测结果(已经帮大家下载好了人和鼠的所有预测结果,可以直接使用),利用R代码批量预测miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间的调控关系 9.第九节,介绍Targetscan数据库,如何查找miRNA的靶基因以及通过靶基因查找调控的miRNA 10.第十节,下载Targetscan预测结果以及注释文件 11.第十一节,基于Targetscan所有的预测结果,利用R代码批量预测miRNA-mRNA之间的调控关系 12.第十二节,windows下如何安装R和Rstudio软件 13.第十三节,mac下如何安装R和Rstudio软件 本地基于序列预测miRNA靶基因 课程网址: https://www.bilibili.com/cheese/play/ss10060 课程二维码:
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