硬核生物信息学系列汇总

01

 R语言基础

Scientific Research

观观老师

手把手教你组学分析！

R语言 | 第1期. 听说你因为不会安装R包而放弃入门R语言？

R语言 | 第2期. 文件导入

R语言 | 第3期. 让你对自己的数据明明白白

R语言 | 第4期. 从原始数据到可视化结果，这个必会的技能你学会了吗

R语言 | 第5期. 你知道如何快速筛选你的变量和观测样本吗？

R语言 | 第6期. 变量修改大全

R语言 | 第7期. 数据合并大全

R语言 | 第8期. R语言绘图临门一脚

R语言 | 第9期. 汇总数据加速包

R语言 | 第10期. 字符串匹配，小菜一碟！

R语言 | 第11期. 字符串修改

R语言 | 第12期. 字符串排序、拼接和分割

R语言 | 第13期. apply家族入门应用

R语言 | 第14期. ggplot2初识

R语言 | 第15期. ggplot2柱状图系列

R语言 | 第16期. ggplot2气泡图系列

R语言 | 第17期. 让chatGPT教你ggplot2

R语言 | 第18期. 无代码ggplot2不香吗？

R语言 | 第19期. 无代码ggplot2不香吗？-第二弹

R包｜第1期. 绪论

R包｜第2期. 你真的了解Dotplot嘛？

R包｜第3期. 单细胞上游！Cellranger包全解！

02

Bulk RNA测序

Scientific Research

Bulk RNA-seq | 第1期. 快2024年了，还有必要学习Bulk RNA-seq？

Bulk RNA-seq | 第2期. 零基础画主成分分析(PCA)图

Bulk RNA-seq | 第3期. 基因ID转换，一键搞定

Bulk RNA-seq | 第4期. 差异分析三巨头，该了解一下了

Bulk RNA-seq | 第5期. 关于热图，你所不知道的

Bulk RNA-seq | 第6期. 火山图，不是你想的那样

Bulk RNA-seq | 第7期. GO富集，我收藏了

Bulk RNA-seq | 第8期. KEGG富集，我收藏了

Bulk RNA-seq | 第9期. GSEA富集，不一样的富集分析

Bulk RNA-seq | 第10期. GSVA富集，给富集分析画一个句号

03

图解单细胞RNA测序

Scientific Research

图解单细胞 | 第1期. UMAP或tSNE降维聚类（再不上车，你就真的错过了！）

图解单细胞 | 第2期. pseudo-bulk将scRNA-seq数据转化为bulk RNA-seq数据

图解单细胞 | 第3期. 惊！看完这篇，我竟学会了单细胞转录组测序组学最常见的热图

图解单细胞 | 第4期. 寻找疾病致病细胞或保护细胞，原来是用这种方法！

图解单细胞 | 第5期. 这种形似树枝的图到底怎么看

图解单细胞 | 第6期. 好不容易看懂了UMAP图，但为什么细胞上又有箭头了呢

图解单细胞 | 第7期. 圆圈和复杂的连线

图解单细胞 | 第8期. 富集分析里的MM豆，也能吃吗？

图解单细胞 | 第9期. 除了GO，KEGG，还能用什么富集分析？

图解单细胞 | 第10期. 单细胞分子层面分析——转录因子分析

图解单细胞 | 第11期. 单细胞研究思路？看完这篇你就明白

图解单细胞 | 第12期. 如何整合bulk RNA和scRNA数据？

图解单细胞 | 第13期. 单细胞WGCNA分析——hdWGCNA

图解单细胞 | 第14期. 单细胞联合GWAS分析

04

单细胞RNA测序数据分析

Scientific Research

单细胞测序 | 第1期. 单细胞测序：揭开生命奥秘的钥匙

单细胞测序 | 第2期. 下游数据质控知多少

单细胞测序 | 第3期. Seurat之PBMC分析标准化流程

单细胞测序 | 第4期. 写文章时需要用到的单细胞转录组测序原理

单细胞测序 | 第5期. 单细胞测序文件面面观

单细胞测序 | 第6期. 10X genomics 上游分析-cellranger介绍

单细胞测序 | 第7期. 10X genomics 上游分析-cellranger应用

单细胞测序 | 第8期. 一文打通单细胞测序研究思路

单细胞测序 | 第9期. Zenodo一个宝藏公共数据库和单细胞的不解之缘

单细胞测序 | 第10期. 生物信息学必须了解的数据库
单细胞测序 | 第11期. 不会还有人不知道这个免费一年的云服务吧！？

单细胞测序 | 第12期. 单细胞分析数据下载、导入和合并

单细胞组学 | 第13期. 单细胞测序中竟然存在双细胞？

单细胞组学 | 第14期. 想发单细胞测序文章？这一步必学！

单细胞组学 | 第15期. 一份强烈推荐收藏的细胞周期校正宝典！

单细胞组学 | 第16期. 不可不知的单细胞流程

单细胞组学｜第17期. 找到Cluster的领头羊

单细胞组学｜第18期. 单细胞注释不再是烦恼！

单细胞组学｜第19期. 单细胞数据分析的核心环节，必学！

单细胞组学 | 第20期. 美无极限——卷起来的UMAP图美化方案

单细胞组学 |  第21期. 点亮数据星空——Dotplot图绘制技巧揭秘

单细胞组学 |  第22期 单细胞转录组基础分析流程详解

单细胞组学 | 第23期. 单细胞数据分析的灵魂，学起来！

单细胞组学 | 第24期. 找到属于你的细胞亚群！

单细胞组学 ｜第25期. 单细胞亚群细分

单细胞组学｜第26期. 一个函数搞定单细胞富集分析！

单细胞组学｜第27期. 想发高分？干湿结合才是王炸！

单细胞组学 | 第28期. 拟时序分析，看这里！

 

05

代谢组学

Scientific Research

代谢组学 | 第1期. 2024年了，上车代谢组学还不晚

代谢组学 | 第2期. 关于代谢组学，你必须了解的事

代谢组学 | 第3期. 即将发车，快来学习代谢组学基本流程与技术

代谢组学 | 第4期. 快来学，一文掌握代谢组学上游分析

代谢组学 | 第5期. 代谢组学多元统计分析，你学会了吗

代谢组学 | 第6期. 富集分析，代谢组学也要有！

代谢组学 | 第7期. 图解代谢组学，有图有真相

代谢组学 | 第8期. 有图有真相，代谢组学图解之多组学进阶

代谢组学 | 第9期. 代谢组学升级到空间层面会发生什么

（更新于2024-11-2）

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编辑：直观
编审：直观