菱塘清真寺,明中叶前初建于回回湾(今清真村),后被洪水冲毁;明中叶迁至杨大庄西头,寺存约一百多年,后因回族增多,寺房狭小,不够使用,乡老鼎力迁寺,迁到今址清真村。
清道光十四年(1834年),回族薛班筹款扩建,有大殿堂、水房、阿訇住房等13间,1921年本地回族杨浩、杨锡章等倡仪,从沪、宁和本地募得银元300余元,于1924年改建新寺,共建成大殿、南北厢房、水房、会客室、殡葬用具房瓦房35间,草房3间,占地约4.3亩,寺房布局协调,殿堂巍峨,屋宇宽敞,大殿可容近200人做礼拜。
2006年6月,经江苏省人民政府批准,古清真寺被明确为江苏省文物保护单位。
2007年,经江苏省文物局批准,菱塘回族乡政府决定以古寺为中心新建民俗风情园。按照修旧如旧原则,对寺内建筑和寺院环境进行了大规模翻修扩建。