二、T2噬菌体的基因重组与作图通过双重感染?两种噬菌体进行杂交?重组的噬菌斑?两基因之间的遗传距离。1.噬菌体遗传性状分为两类: 形成的噬菌斑形状:指噬菌斑大小、边缘清晰度、透明程度。寄主范围:指噬菌体感染和裂解的菌株范围。2.T2噬菌体的研究最为广泛 :①正常噬菌体r+:噬菌斑小而边缘模糊。r-突变体(rapidlysis,速溶性):噬菌斑大而边缘清楚。②寄主范围突变体 :指能克服噬菌体抗性的突变体。例:T2h+噬菌体:只侵染大肠杆菌B株;半透明噬菌斑。T2h-突变株:能利用B株 和B/2株;透明噬菌斑。B/2株是大肠杆菌B株的突变体,它对T2噬菌体有抗性。这种突变体叫宿主范围突变体。③.双重感染: h-和h+均能感染B株?可用T2两个亲本h-r+和h+r同时感染B株。h-r+(透明,小)×h+r-(半透明,大) ↓同时感染B菌株获得噬菌体子代亲本型:h-r+,h+r-重组型:h-r-,h+ r+将亲本型和重组型混合子代↓感染混合有B和B/2菌株的培养基↓h-r+(亲):噬菌斑透明、小,边缘 模糊h+r-(亲):噬菌斑半透明、大,边缘清楚h-r-(重组):噬菌斑透明、小,边缘清楚h+r+(重组):噬菌斑半透明、小, 边缘模糊⑤.不同速溶菌的突变型在表现型上不同,可分别写成ra、rb、rc等,用rx-h+×rx+h-获得试验结果列于下表: 分别作出ra、rb、rc与h的三个连锁图四种可能的基因排列连锁图三、λ噬菌体的基因重组与作图凯泽(Kais erA.D.,1955)最先进行λ噬菌体的重组作图试验。紫外线照射处理?获5个λ噬菌体突变系,产生不同噬菌斑:s系: 小噬菌斑;mi系:微小噬菌斑;c系:完全清亮的噬菌斑;co1系:中央环之外部分表现清亮的噬菌斑;co2 系:更浓密的中央环噬菌斑。凯泽利用λ噬菌体sco1mi与噬菌体+++进行杂交作图:㈢、中断杂交试验及染色体连锁图50年代 ,雅科(JacobF.)和沃尔曼(WollmanE.):中断杂交试验:发现接合时遗传物质转移是直线进行。其方法为:⑴ .Hfr菌株与F-菌株混合培养。Hfr菌株:strsa+b+c+d+对链霉素敏感F-菌株:strra-b -c-d-抗链霉素⑵.不同时间取样?搅拌器中断杂交?稀释?含链霉素完全培养基?杀死Hfr细菌?抗str细菌菌落?影印 培养法:鉴定a+b+c+d+各基因转移时间。⑶.实例:Hfr菌株:苏氨酸(thr+)、亮氨酸(leu+)、抗叠氮化物(azir )、抗T1噬菌体(tonr)、半乳糖(gal+)、乳糖(lac+)。F-菌株:thr-、leu-、azis、tons、gal-、 lac-型。①8分钟时:thr+进入F-细胞;8.5分钟时:leu+进入F-细胞;②9分钟时:出现叠氮化物抗性的菌落, 少数azir基因进入F-细胞;③11分钟时:出现抗噬菌体T1的F-细菌;④18和25分钟时:分别出现乳糖和半乳糖发酵基因, 即lac+和gal+进入F-细胞。①.重组体中各标志基因进入F-细胞中时间不同,达到最高水平的时间也不同;②.随时间的推迟 ,某个基因的重组率增加;一定程度后,重组率便不再增加。如:10’tonr首次出现,15’时40%、25’后80%。∴Hfr中 基因是按一定的线性顺序依次进入F-菌株的。表7-5大肠杆菌Hfr+thr+leu+lac+gal+azistonsstrs ×F-thr-leu-lac-gal-azirtonrstrr的结果⑷.用一种大肠杆菌的不同Hfr菌株进行中断杂交实验, 作出连锁图,其基因向F-细胞转移的顺序不同。转移的顺序是不是随机?例如:thrthigly。Hfr1和HfrAB312 菌系的中断杂交试验及其连锁图(下图):这进一步说明了F因子和细菌染色体都是环状。㈣、重组作图两基因转移时间间距 <2分钟时,中断杂交法的图距不够精确,应采用传统的重组作图法。例:二个基因紧密连锁:lac-(乳糖不发酵) ade-(腺嘌呤缺陷型)两个位点间的时间约为1分钟,约相当于2 0%的重组值。2.测定细菌基因间的连锁关系:以普遍性转导噬菌体P1为例,测定大肠杆菌的leu(亮氨酸合成)、thr(苏氨酸合成 )、azi(叠氮化钠抗性)三个基因的顺序。小结:细菌遗传分析中的基因转移基因间重组频率三、性导(sexduction): 性导:指接合时由F’因子所携带的外源DNA整合到细菌染色体的过程。F因子整合过程:可逆,发生环出时,F因子又可重新离开染色 体。Adelberg和Burns(1959):F因子偶尔在环出时不够准确,会携带出染色体上的一些基因,这种因子称为F’因子。 F’因子携带染色体的节段大小:从一个标准基因到半个细菌染色体。F’因子使细菌带有某些突出的特点:⑴.F’因子转移基因比 率极高,如同F+因子转移比率;⑵.F’因子的自然整合率极高,并且整合在一定的座位上。∵携带有与细菌染色体一样的同源区段;而正 常F因子可在不同座位整合。雅科和阿代尔伯格发现:特殊的Hfr菌株能把lac+等位基因高频率地转移到Flac-受体之中。 ∵①.lac基因位于远端,中断杂交实验中只有1/1000重组率;②.由F’携带lac+基因进入受体后可在lac位点上形成部分 二倍体F''lac+/lac-。性导在大肠杆菌遗传研究中的作用:①.每个F’因子携带有不同大肠杆菌基因,包括全部染色体基 因,可以分离出大量的F’因子,利用不同基因在一起的并发性导的频率来作图;②.通过性导产生部分二倍体,确定等位基因位置、显隐性关系 提供了重要方法;③.性导形成的部分二倍体可用作互补测验,确定两个突变类型是否属于同一个基因。1.概念:是指以噬菌体为媒介进行 细菌遗传物质重组的过程,是细菌遗传物质传递和交换方式之一。2.特点:以噬菌体为媒介?细菌的一段染色体被错误地包装在噬菌体的蛋 白质外壳内?通过感染转移到另一个受体细胞内。∵感染细菌的能力决定于噬菌体的蛋白质外壳。四、转导(transduction) :3.例如:黎德伯格与津德(1951)发现鼠伤寒沙门氏菌中转导现象。⑴.将两个沙门氏菌的营养缺陷型进行杂交:phe-t ry-tyr-met+his+×phe+try+tyr+met-his-↓混合培养在基本培养基发现原养型的菌 落频率为1/105不能合成苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸不能合成甲硫氨酸和组氨酸⑵.产生上述结果的原因:①.是否属于恢复 突变?高频率的出现不可能是回复突变。②.是否属于接合、性导?戴维斯U型管试验(防止细胞直接接触)?结果也获得野生型重组体 ,排除由于接合或性导而产生基因重组可能性。③.是否属于转化?结果表现为不受DNA酶的影响,排除了由于DNA片断通过滤片经转化实 现基因重组可能性。⑶.唯一可能的结论是:这种重组通过一种过滤性因子实现。这种过滤性因子称为FA,不受DNA酶的影响。FA是 一种噬菌体,称为P22,溶源性的。转导可分为普遍性转导和特殊性转导两大类。㈠、普通性转导:转导颗粒:把细菌染色体片段包装在 噬菌体蛋白质外壳内而产生的假噬菌体,其中并不包含噬菌体的遗传物质。1.作用:可以转导细菌染色体组的任何不同部分。。第三 节细菌的遗传分析一、转化(transformation):概念:指某些细菌能通过其细胞膜摄取周围供体的染色体片段,将此外源 DNA片段通过重组加入自己染色体组的过程。1928年,格里费斯(GriffithF.)在肺炎双球菌中发现转化现象。1944年 ,阿委瑞(AveryO.T.)成功地进行了肺炎双球菌转化试验;证实遗传物质是DNA;转化是细菌交换基因的方法之一。???细 菌中的大部分的转化工作是用下面三种细菌完成的:肺炎双球菌,枯草杆菌和流感嗜血杆菌。转化主要分为二个步骤进行:(一)供体DNA与 受体细胞间的接触与互作肺炎双球菌转化:DNA片断至少有800个碱基对;枯草杆菌的转化:DNA片断至少有16000个碱基对。 转化的第一步是使转化DNA与受体细菌间的成功地相互作用,这包括:转化片段的大小、形态、浓度和受体细胞的生理状态。①.转 化片断的大小:②.供体DNA分子存在的数目:对特定基因来说,供体DNA分子数目与成功转化有关。链霉素抗性基因转化:在每个细胞 含有10个DNA分子之前,抗性转化体数目一直与DNA分子存在数目成正比。原因:在细菌的细胞壁或细胞膜上有固定数量的DNA接受座位 ,故一般细菌摄取的DNA分子数小于10个。③.受体的生理状态:受体细胞必须在生理上处于感受态。这种感受态只能发生在细 菌生长周期的某一时间范围内,在感受态内,活跃合成的蛋白质的细菌细胞壁多少发生改变而易于接受转化DNA。㈡、转化DNA的摄取和整合 过程:细菌中的转化,包括供体DNA的结合与穿入,联会和整合。当细菌处于感受态时,外源双链DNA分子可结合在受体细胞表 面的接受座位上。细菌在摄取外源DNA时,由DNA移位酶降解其中一条链,并利用降解这条链产生的能量,将另一条链拉进细胞中。??? ①.结合与穿入:供体单链DNA片段一旦进入细胞,按各个不同的位点与其相应的受体DNA片段联会。??②.联会:单链的 转化DNA通过与受体DNA对应位点的置换从而稳定地参入到受体DNA中。③.整合(重组):转化动画(三)转化和基因重组作图 例如:黎德伯格等用枯草杆菌进行转化和重组试验DNA片段进入受体细胞之后,可与受体染色体发生重组。紧密连锁的两个基 因有较多的机会包括在同一个DNA片段中,并同时整合到受体染色体中。Trp2 his2tyr1<-----------34-----------><- ---13-------><--------------------40--------------------->三者并发 转化的频率最高,故这3个基因是连锁的,其中his2和tyr1连锁紧密:单交换时,染色体开环易降解,故不存在单交换类型;只有双 交换和偶数的多交换才有效的。二、接合(conjugation):1.概念:是指原核生物的遗传物质从供体(donor)转移 到受体(receptor)内的过程。特点:需通过细胞的直接接触。B菌株:Met+bio+thr-leu-,需加苏氨 酸和亮氨酸。不同营养缺陷型的大肠杆菌:A菌株:Met-bio-thr+leu+,需加甲硫氨酸和生物素。2.实例:黎 德伯格和塔特姆(1946年):A菌株和B菌株营养缺陷型,不能在基本培养上生长。A+B菌株混合培养,在完全培养基上,几小时后离心 ,涂布基本培养,长出原养型(Met+bio+thr+leu+)菌落。这种原养型细胞如何出现?转化?细胞间直接接触而发生遗 传物质交换和重组?A、B菌株分别培养在基本培养基上?一边加压和吸引使培养液充分混合?结果任何一臂的培养基上均未长出原养型 细菌。∴直接接触(接合)是原养型细胞出现的必要条件。Hayes(1952)试验证明:接合过程是一种单向转移,A菌株遗传物质 ?B菌株,从供体“donor”到受体“receptor”。⑴.F因子:致育因子(性因子),是一种附加体。携带F因子的菌株 称为供体菌或雄性,用F+表示。未携带F因子的菌株为受体菌或雌性,用F-表示。㈠、F因子及F+向F-的转移:⑵.F因子的组成 :染色体外遗传物质,环状DNA;40-60个蛋白质基因;2-4个/细胞(雄性内)。⑶.F因子的三种状态:以大肠杆 菌为例:②.一个自主状态F因子,即F+;③.带有一个整合的F因子的细胞叫高频重组细胞,Hfr细胞。①.没有F因子,即F- ;⑷.自主状态时F因子独立进行分裂。F+×F-:先形成接合管,F因子的DNA边转移边复制,F-细胞?F+细胞。当F因子 复制完成后,F-变成F+(动画)。????????????F因子整合到细菌染色体上(F+?Hfr细胞),其繁殖与细菌染 色体同步进行。此时,细菌基因的重组频率增加4倍以上,因此染色体上整合有F因子的菌株,称为Hfr菌株。㈡、Hfr细胞的形成及染色 体的转移:细菌染色体由一小段单链的F因子为前导而转移到F-受体?边进入边合成。一般情况下仅小部分细菌染色体能够转入,接合中断 ?受体细胞仍为F-,F因子仍留在供体内。部分二倍体中发生交换:单数交换:打开环状染色体,产生一个线性染色体,这种细胞是不能 成活的。偶数交换:产生可遗传的重组体和片段。部分二倍体:当F+或Hfr的细菌染色体进入F-后,在一个短时期内,F-细胞内的某些 位点就会成为二倍体的DNA。2525gal+4018lac+7011tons909azis100(经选择 的)8.5leu+100(经选择的)8thr+频率转入的时间(分钟)标记基因下图为以基因出现的时间为标准?? ???作出E.coli的遗传连锁图。thithrprolacgurgalhisglyOAB312purl acprothrthiglyhisgalO3prothrthiglyhisgalpurlacO 2thrthiglyhisgalpurlacproO1thrprolacpurgalhisgly thiOHfrH基因转移顺序原点Hfr类型差异:不同Hfr菌株转移的原点(O)和转移方向不同。第七 章细菌和病毒的遗传细菌和蓝绿藻属于原核生物:一个线条状或环状染色体(单倍体结构);无典型的有丝分裂和减数分裂;染色体传递 和重组方式与真核生物不同。病毒:比细菌更简单;在寄主细胞内以集团形式产生;属于只有一条染色体的单倍体。第一节细菌和 病毒遗传研究的意义1.大小:细胞较小、长约1.2um、宽约0.5um;2.结构:鞭毛、细胞壁、质膜、间体、核质体、核糖体3 .遗传物质:单个主染色体、一个或多个小染色体(质粒)一、细菌:???研究细菌遗传的方法:主要是对细菌菌落形态的遗传研究(如 图,霉菌菌落)原则上说,培养皿中每个细菌长成的菌落应具有共同的遗传组成,但是由于偶然发生的突变:形态性状的突变,生理特性的突变 或抗性的突变,而使这些突变后的细菌所形成的菌落与其他的菌落有所不同。菌落形态性状的突变包括:菌落的形状、颜色和大小等。(如图, 菌落形态性状)4.涂布和繁殖:每个细胞在较短时间内(如一夜)能裂殖到107个子细胞?成为肉眼可见的菌落或克隆(Clone) 。5.生理特性突变:①.营养缺陷型:丧失合成某种营养物质能力,不能在基本培养基上生长;原养型:野生菌株则可在基本培养基 上生长。用不同的选择性培养基?测知突变的特性。②.抗性突变型:如抗药性或抗感染性。例如:青霉素(penr,r代表re sistance)抗性突变的菌落。测定突变的方法──影印法:黎德伯格等(Lederberg和Lederberg,1952)设计 。LederbergJ.,1958Nobel奖获得者,发现细菌转导和接合培养基中加有青霉素抗青霉素的菌?生长没 有细胞结构,是单倍体,只有一条染色体。病毒?蛋白质外壳+包被在内的核酸。病毒分类:寄主:动物、植物、细菌;遗传物质 :DNA或RNA。二、病毒:病毒中没有合成蛋白质外壳所必须的核糖体。所以,病毒必须感染活细胞,改变和利用活细 胞的代谢合成机器,才能合成新的病毒后代。感染细菌的病毒又叫噬菌体(bacteriophage),是目前了解比较清 楚的病毒。噬菌体对于分子生物学的研究具有非常重要的贡献。常见几个主要噬菌体的特性质见表7-1。图7-11.世代周期短: 大肠杆菌(E.Coli)20分钟可繁殖一代。2.便于管理和生化分析:个体小,一般在1u至几u之间,因一支试管可以 储存数以百万计的细菌和病毒,操作管理方便。三、细菌和病毒在遗传研究中的优越性:3.便于研究基因突变:裸露的DNA分子 (有的病毒为RNA分子),易受环境条件的影响而发生突变;单倍体生物,不存在显性掩盖隐性问题,突变均能表现出来。4.便于研究基因的 作用:影印培养,易检出营养缺陷型突变,有利于从生化角度来研究基因的作用。5.便于基因重组研究:细菌具有转化 、转导和接合作用,利用这些特性可以进行精密的遗传学分析。6.便于研究基因结构、功能及调控机制:细菌和病毒的遗传物质简 单,基因定位、结构分析及其分离易于进行,基因的表达调控也适于用生理生化的方法进行深入的研究。7.便于进行遗传操作:染 色体结构简单,没有组蛋白和其它蛋白的结合,更宜于进行遗传工程的操作。第二节噬菌体的遗传分析1.结构简单:蛋白质外壳、 核酸、某些碳水化合物、脂肪等。2.多样性的原因:外壳的蛋白质种类、染色体类型和结构的不同。3.两大类(据噬菌体DNA在宿 主细菌内的特点):①烈性噬菌体:能引起寄主细胞裂解的噬菌体。例:T噬菌体系列(T1-T7);②温和性 噬菌体:侵入寄主细胞后,不使寄主细胞裂解的噬菌体。具容源性的P1和λ噬菌体。一、噬菌体的结构:㈠、烈性噬菌体:1.结构大 同小异,外貌一般呈蝌蚪状:头部:双链DNA分子的染色体;颈部:中空的针状结构及外鞘;末端:由基板、尾针和尾丝组成。T偶列噬 菌体2.T偶列噬菌体的侵染过程(如T4噬菌体):尾丝固定大肠杆菌,遗传物质注入?破坏寄主细胞原有的遗传物质?合 成大量的噬菌体遗传物质和蛋白质?组装成许多新的子噬菌体?溶菌酶裂解细菌?释放出数百个噬菌体。㈡、温和性噬菌体:例 如λ和P1噬菌体.λ和P1各代表一种略有不同的溶源性类型。①.λ噬菌体:噬菌体侵入后,细菌不裂解?附在E.coli 染色体上的gal和bio位点间的attλ座位上?通过交换整合到细菌染色体,并能阻止其它λ噬菌体的超数感染。1.溶源性的生活 周期:②.P1噬菌体:它并不整合到细菌的染色体上,而是独立地存在于细胞质内。只有少数基因活动,表达出阻碍物关闭其它基因。原 噬菌体经诱导可转变为烈性噬菌体?裂解途径。原噬菌体:整合在宿主基因组中的噬菌体。2.P1和λ噬菌体的特性:①.P1和λ 各代表不同的溶原性类型:P1噬菌体:侵入后并不整合到细菌的染色体上,独立存在于细胞质内;λ噬菌体:通过交换整合到细菌染色体上。②.溶源性细菌分裂?两个子细胞:P1噬菌体复制则使每个子细胞中至少含有一个拷贝;λ噬菌体随细胞染色体复制而复制,细胞中有一个拷贝。③.共同特点:核酸既不大量复制,也不大量转录和翻译。④.重组值计算:重组值=重组噬菌斑数/总噬菌斑数×100%=[(h+r++h-r-)/(h+r-+h-r++h+r++h-r-)]×100%去掉%即可作为图距。1.6/99.6=1.6%0.90.759.039.0rch+×rc+h-12.3/100.3=12.3%6.45.956.032.0rbh+×rb+h-24.0/100=24%12.012.042.034.0rah+×ra+h-r-h-r+h+r+h-r-h+重组值各基因型(%)杂交组合再做杂交:rcrb+×rc+rb↓结果表明:rc-rb的重组值>rb-h∴h应位于rb及rc之间,排列顺序??rc-h-rb。由于T2噬菌体的连锁图是环状的,所以2、3排列都对 |
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